RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 CD164Q04900 197 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 C10orf25Q5T742 122 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 A0A087WTM6 91 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 PSPHP1O15172 72 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 DIRC1Q969H9 104 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 PKD1P98161 4303 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS3-201ENST00000318129 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 SMIM29Q86T20 159 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 RTL8CO15255 209 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 A8MU10 97 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 TNP2Q05952 138 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 A8MUN3 132 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.46□□□□□ -1.37
GINS3-201ENST00000318129 Q5VV11 94 aa6.46□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 C16orf90A8MZG2 172 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.45□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 UBE2BP63146 152 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 PRR4Q16378 134 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.43□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 A0A096LNI7 61 aa6.42□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 VPREB1P12018 145 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 A0A1B0GW54 56 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 M0R378 163 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 UBE2AP49459 152 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS3-201ENST00000318129 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 NDUFB1O75438 58 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 DSCR10P59022 87 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP10-2P60368 255 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 A0A1W2PNM2 257 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 Q8N377 158 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.38□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 CHTF8P0CG12 524 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 FAM168BA1KXE4 195 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 LIMD2Q9BT23 127 aa6.37□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 K7EQZ3 153 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 A0A1W2PNN7 141 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 HCG22E2RYF7 251 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 LCA10Q71F78 164 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 C7orf33Q8WU49 177 aa6.35□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 A0A1B0GVY2 172 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 A6NN06 94 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 NDUFS5O43920 106 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 FAT1Q14517 4588 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS3-201ENST00000318129 Q8NBF4 154 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 SPRR4Q96PI1 79 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 PANO1I0J062 215 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 PRR15LQ9BU68 103 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 C1orf137Q5JT78 98 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 LINC00208Q96KT6 92 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 Q9BRP9 147 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 KRTAP10-1P60331 282 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 Q75L30 129 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 MP68P56378 58 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.31□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZSA8 131 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.3□□□□□ -1.4
GINS3-201ENST00000318129 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.3□□□□□ -1.4
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