RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.14□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 DNAL4O96015 105 aa7.13□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.13□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.12□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 UBE2BP63146 152 aa7.12□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.12□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 LINC00167Q96N53 147 aa7.12□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.12□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 SPAG11BQ08648 103 aa7.11□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 FAM168BA1KXE4 195 aa7.1□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 F8WDY8 70 aa7.1□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 C5orf38Q86SI9 138 aa7.1□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.1□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 TMEM126AQ9H061 195 aa7.1□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.1□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 KIAA0087Q14695 138 aa7.09□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.09□□□□□ -1.27
SPC25-201ENST00000282074 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.08□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 GHRHP01286 108 aa7.08□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 A0A0U1RRA0 63 aa7.08□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 C22orf24Q9Y442 160 aa7.08□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 ZNF861PO60384 105 aa7.07□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.07□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.07□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.07□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.07□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.07□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.07□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.06□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 CRYGAP11844 174 aa7.05□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.05□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.05□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 MUC17Q685J3 4493 aa7.05□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.04□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 PFN2P35080 140 aa7.04□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.04□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.04□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.03□□□□□ -1.28
SPC25-201ENST00000282074 PDE6GP18545 87 aa7.02□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 TPRXLQ17RH7 258 aa7.02□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 C10orf25Q5T742 122 aa7.02□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 Q6JHZ5 121 aa7.02□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.02□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.02□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 A0A087X002 238 aa7.01□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 CCKP06307 115 aa7□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 RETNLBQ9BQ08 111 aa7□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.99□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 IGLV6-57P01721 117 aa6.99□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 ATOX1O00244 68 aa6.98□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.98□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.97□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 BCE1O60756 84 aa6.97□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 LINC00575Q6W349 94 aa6.97□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 UQCRQO14949 82 aa6.96□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.96□□□□□ -1.29
SPC25-201ENST00000282074 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.95□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.94□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.94□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 hADV29S1A0JD25 119 aa6.94□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.94□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.94□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 C6orf99Q4VX62 202 aa6.93□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.93□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.93□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.92□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 B5MCH6 92 aa6.91□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 COX7CP15954 63 aa6.91□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 UBL5Q9BZL1 73 aa6.91□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 LINC00846Q9NV44 126 aa6.91□□□□□ -1.3
SPC25-201ENST00000282074 A0A1B0GW54 56 aa6.9□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 CCDC179H3BU77 68 aa6.9□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 M0R378 163 aa6.9□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.89□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 NCR3O14931 201 aa6.89□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.89□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 Q6ZQT0 140 aa6.88□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.88□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 UBE2AP49459 152 aa6.87□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.87□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 SERP2Q8N6R1 65 aa6.87□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 VPREB1P12018 145 aa6.86□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 COX7BP24311 80 aa6.86□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 CXCL6P80162 114 aa6.86□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 DSCR8Q96T75 97 aa6.86□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.85□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SPC25-201ENST00000282074 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.5 ms