RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 A8MUN3 132 aa5.53□□□□□ -1.52
HERC3-201ENST00000264345 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 Q1T7F1 81 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 A0A0G2JQZ4 141 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 COL12A1Q99715 3063 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WTM6 91 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 C8orf87E5RJ46 101 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GVX0 72 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 ZNF861PO60384 105 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 LY6G6CO95867 125 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 APCP25054 2843 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 LCE6AA0A183 80 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 COA5Q86WW8 74 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 ZANQ9Y493 2812 aa5.46□□□□□ -1.53
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GU69 56 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 FBN2P35556 2912 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 RELNP78509 3460 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 CD164Q04900 197 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 ACYP2P14621 99 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 ATRQ13535 2644 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2-30P06310 120 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 LINC00483Q53H64 154 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 IGLV7-43P04211 117 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 LINC00313P59037 77 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 FAM229AH3BQW9 127 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.41□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
HERC3-201ENST00000264345 ZFHX3Q15911 3703 aa5.4□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 MAST4O15021 2626 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.38□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZR54 194 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 PDZD2O15018 2839 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 Q75L30 129 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC3-201ENST00000264345 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.32□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.32□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 PANO1I0J062 215 aa5.31□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.31□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.31□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.31□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 ITPR2Q14571 2701 aa5.3□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 Q5VV11 94 aa5.29□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 Q96NJ1 140 aa5.28□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 LCA10Q71F78 164 aa5.28□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 UQCR11O14957 56 aa5.28□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.28□□□□□ -1.56
HERC3-201ENST00000264345 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.27□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 NF1P21359 2839 aa5.26□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 HRES1P13985 223 aa5.25□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.25□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 HIVEP1P15822 2718 aa5.24□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 VPS13CQ709C8 3753 aa5.24□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 AKAP9Q99996 3911 aa5.23□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.23□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.23□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.22□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.22□□□□□ -1.57
HERC3-201ENST00000264345 Q5W150 140 aa5.21□□□□□ -1.58
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