RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.59□□□□□ -1.83
LMO3-201ENST00000261169 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
LMO3-201ENST00000261169 C1orf195Q5TG92 126 aa3.59□□□□□ -1.83
LMO3-201ENST00000261169 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.59□□□□□ -1.83
LMO3-201ENST00000261169 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.59□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 IGFL1Q6UW32 110 aa3.58□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 BCE1O60756 84 aa3.58□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.57□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 Q8NDZ9 215 aa3.57□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PNM2 257 aa3.56□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.56□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.56□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 K7ERS5 55 aa3.56□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.55□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 A0A087WTM6 91 aa3.55□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 LINC00313P59037 77 aa3.54□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.54□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.54□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.53□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 LIMD2Q9BT23 127 aa3.53□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 DSCR10P59022 87 aa3.53□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 Q96NJ1 140 aa3.53□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 A8MUN3 132 aa3.53□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 A8MWP4 228 aa3.53□□□□□ -1.84
LMO3-201ENST00000261169 APLNQ9ULZ1 77 aa3.52□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.52□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 ZNF861PO60384 105 aa3.52□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 PRR15Q8IV56 129 aa3.52□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.51□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 VWFP04275 2813 aa3.51□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 H7BZZ5 65 aa3.51□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.51□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GU69 56 aa3.51□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 TNP2Q05952 138 aa3.51□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 LINC01600Q96MT4 127 aa3.51□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GW54 56 aa3.5□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 C9orf92A6NGG3 77 aa3.5□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.5□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.5□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 ACYP2P14621 99 aa3.49□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 FAM229AH3BQW9 127 aa3.49□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 KLKP1Q107X0 134 aa3.49□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 PRO0628Q9UI54 55 aa3.48□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.48□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 PDZD2O15018 2839 aa3.48□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.48□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 COA5Q86WW8 74 aa3.48□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.47□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 SPRR4Q96PI1 79 aa3.47□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.47□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.47□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.47□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GVX0 72 aa3.47□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 IGLV7-43P04211 117 aa3.47□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
LMO3-201ENST00000261169 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.46□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.46□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.45□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.45□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 H3BPC8 53 aa3.44□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.44□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 Q8N1X5 172 aa3.44□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.44□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 ZFHX3Q15911 3703 aa3.44□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 WIPF1O43516 503 aa3.43□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 OCR1Q9BZK8 76 aa3.43□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 TENM2Q9NT68 2774 aa3.42□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 C8orf87E5RJ46 101 aa3.41□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.41□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.41□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 CSMD2Q7Z408 3487 aa3.41□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.41□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 TGP01266 2768 aa3.41□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 PANO1I0J062 215 aa3.41□□□□□ -1.86
LMO3-201ENST00000261169 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.4□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 BSNQ9UPA5 3926 aa3.4□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 SPRR1AP35321 89 aa3.39□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 J3QL48 77 aa3.38□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.37□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 UQCR11O14957 56 aa3.37□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 A0A0D9SG42 100 aa3.36□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 KRTAP10-2P60368 255 aa3.36□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 LINC01554Q52M75 96 aa3.36□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.35□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.35□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.34□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.34□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 HRES1P13985 223 aa3.34□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.34□□□□□ -1.87
LMO3-201ENST00000261169 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.34□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.9 ms