RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901	UQCRQ	O14949	82 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A087WVE0	104 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901		M0R378	163 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	COX7B	P24311	80 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6JHZ5	121 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901		M0R2N4	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6ZQT0	140 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	CRYGA	P11844	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	COX7C	P15954	63 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	SEC61G	P60059	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM258	P61165	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATOX1	O00244	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901		H3BQ85	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q5XG85	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6ZVQ6	151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	PDE6G	P18545	87 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	HAMP	P81172	84 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	RMI2	Q96E14	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901		H3BS24	57 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901		V9GYY9	64 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q8N377	158 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q9BRP9	147 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6ZRX8	168 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	OXT	P01178	125 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRY	O14603	147 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPRR1A	P35321	89 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SAMMSON-222	ENST00000641901	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	LY6G6C	O95867	125 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	CXCL6	P80162	114 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A096LNI7	61 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	PSCA	O43653	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A1W2PNN7	141 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	UBE2B	P63146	152 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SAMMSON-222	ENST00000641901	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65

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