RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638075.1

EFHC1-238, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-238	ENST00000638075	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		5.89	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		5.89	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		5.89	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		5.89	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075		H0Y8G0	127 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	LEPROT	O15243	131 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	PLN	P26678	52 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	UBE2V1	Q13404	147 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.88	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	PRY	O14603	147 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	COX8A	P10176	69 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5.87	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	NCR3	O14931	201 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	VAMP3	Q15836	100 aa		5.86	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075		J3QQQ9	107 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	DPM2	O94777	84 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5.85	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075		A6NDN8	102 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	IGKC	P01834	107 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	NMU	P48645	174 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	DAND5	Q8N907	189 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
EFHC1-238	ENST00000638075	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	HERVK_113	P61574	105 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	HSD52	Q0P140	79 aa		5.83	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075		B5MCH6	92 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	TAX1BP3	O14907	124 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	NDUFC2	O95298	119 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	LINC00483	Q53H64	154 aa		5.82	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075		E9PLD3	99 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	IGLV6-57	P01721	117 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075		A0A0J9YXY3	114 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075		Q6ZRX8	168 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075		Q8NBF4	154 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075		Q9BRP9	147 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	HIGD1B	Q9P298	99 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	C9orf118	A6NHY6	69 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	CDIP1	Q9H305	208 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EFHC1-238	ENST00000638075	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	SPINK1	P00995	79 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	LCE2C	Q5TA81	110 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075		Q6ZVH6	145 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075		K7ERU9	68 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	TAL2	Q16559	108 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	LITAF	Q99732	161 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075		A0A0U1RQV1	116 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	NPC2	P61916	151 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	MUC17	Q685J3	4493 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075		K7EP34	96 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	TIMM17B	O60830	172 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	MOBP	Q13875	183 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	FABP2	P12104	132 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	PCP4	P48539	62 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	XP32	Q5T750	250 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	SPANXC	Q9NY87	97 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075		A0A1W2PPM0	123 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075		H3BUT2	72 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	PCP2	Q8IVA1	136 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	VPS25	Q9BRG1	176 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFHC1-238	ENST00000638075	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-238	ENST00000638075	ZNF815P	A8K554	130 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-238	ENST00000638075	CEND1	Q8N111	149 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-238	ENST00000638075		Q8N377	158 aa		5.71	□□□□□ -1.5
EFHC1-238	ENST00000638075	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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