RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636969.1

SMARCA2-256, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, human

TSL 5

Gene SMARCA2, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCA2-256	ENST00000636969	LINC00167	Q96N53	147 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	AMELX	Q99217	191 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	SPANXC	Q9NY87	97 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		Q9UF83	564 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	PRO0461	Q9UI25	63 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		V9GYV3	84 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		0.45	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	RYR2	Q92736	4967 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		A0A0U1RRA0	63 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		A0A1B0GX51	115 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		A0A1B0GXF2	115 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		A0A1W2PNN7	141 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	TMEM223	A0PJW6	202 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		A6NDN8	102 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		H0Y8G0	127 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		H0YGX0	51 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	SMKR1	H3BMG3	65 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		J3KT08	172 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		J3QQQ9	107 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		K7EN84	100 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	NCR3	O14931	201 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	TIMM17B	O60830	172 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	IGLV6-57	P01721	117 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	IGKC	P01834	107 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	APOC3	P02656	99 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	S100A6	P06703	90 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	SPINK8	P0C7L1	97 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	IGLC3	P0DOY3	106 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	S100A2	P29034	98 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	KRTDAP	P60985	99 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	PRLH	P81277	87 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	MOBP	Q13875	183 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		Q1RN00	199 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		Q6Q795	121 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	PET117	Q6UWS5	81 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	C2orf82	Q6UX34	121 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		Q6ZRX8	168 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	RAB37	Q96AX2	223 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	SPRR4	Q96PI1	79 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		Q9BRP9	147 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	KMT2A	Q03164	3969 aa		0.44	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		A0A1B0GW54	56 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	hADV29S1	A0JD25	119 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	FAM168B	A1KXE4	195 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	TMEM218	A2RU14	115 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	LINC01546	A6NGU7	62 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	IGIP	A6NJ69	53 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		A8MU10	97 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	C8orf87	E5RJ46	101 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	TSTD3	H0UI37	97 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	TRAC	P01848	142 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	SMIM13	P0DJ93	91 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	MT1HL1	P0DM35	61 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	VPREB1	P12018	145 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	FABP4	P15090	132 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	PDE6G	P18545	87 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	PSMB2	P49721	201 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	DSCR10	P59022	87 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	LINC00313	P59037	77 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	KRTAP10-5	P60370	271 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	KRTAP10-12	P60413	245 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	UBE2V1	Q13404	147 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	KIAA0087	Q14695	138 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	PMCHL1	Q16048	86 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	LINC00483	Q53H64	154 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	CLLU1	Q5K131	121 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969		Q5XG85	94 aa		0.43	□□□□□ -2.34
SMARCA2-256	ENST00000636969	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34

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