RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621573.1

TARDBP-224, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 3

Gene TARDBP, Length 992 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-224	ENST00000621573	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573		A0A0J9YXY3	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	DAND5	Q8N907	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TARDBP-224	ENST00000621573	NPC2	P61916	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573		M0R378	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	NCR3	O14931	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573		Q8NDZ9	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	TIMM17B	O60830	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	BCE1	O60756	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	UBE2A	P49459	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	ZNF861P	O60384	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	OXT	P01178	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TARDBP-224	ENST00000621573	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	NDUFC2	O95298	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	DDT	P30046	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573		H0Y9J4	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	IFITM1	P13164	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573		Q6ZVH6	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	COX8A	P10176	69 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	PRLH	P81277	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	DLEU1	O43261	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573		A6NDN8	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	SPRR1A	P35321	89 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-224	ENST00000621573	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-224	ENST00000621573	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TARDBP-224	ENST00000621573		A4D1N5	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TARDBP-224	ENST00000621573	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TARDBP-224	ENST00000621573	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TARDBP-224	ENST00000621573	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TARDBP-224	ENST00000621573	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TARDBP-224	ENST00000621573	CRYGA	P11844	174 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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