RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593061.5

ILF3-223, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 3

Gene ILF3, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	DLEU1	O43261	78 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061		Q6ZVH6	145 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	COPS9	Q8WXC6	57 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	PRY	O14603	147 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	NDUFC2	O95298	119 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	C14orf144	Q96I85	54 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ILF3-223	ENST00000593061	IFITM1	P13164	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	S100A12	P80511	92 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	SPRR4	Q96PI1	79 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ILF3-223	ENST00000593061	SPRR1A	P35321	89 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	HIGD1B	Q9P298	99 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	SMIM6	P0DI80	62 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	MUC2	Q02817	5179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	DDT	P30046	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	HIST1H4G	Q99525	98 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	IGLV6-57	P01721	117 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ILF3-223	ENST00000593061		B5MCH6	92 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	CTAG1A	P78358	180 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	TAL2	Q16559	108 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061		A4D1N5	150 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061		Q8NBF4	154 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	ERC2-IT1	O76042	136 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	CDIP1	Q9H305	208 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ILF3-223	ENST00000593061	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		11.02	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061		A6NDN8	102 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	TPRXL	Q17RH7	258 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	LINC00483	Q53H64	154 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061		Q6ZRX8	168 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061		Q9BRP9	147 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	MUC17	Q685J3	4493 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	PRO1933	Q9H354	126 aa		11	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	CEND1	Q8N111	149 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	C12orf57	Q99622	126 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	HSD52	Q0P140	79 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	MOBP	Q13875	183 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ILF3-223	ENST00000593061	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		10.95	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061		A6NJY4	79 aa		10.95	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061		A0A0U1RQV1	116 aa		10.94	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	SPINK1	P00995	79 aa		10.94	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	CFC1B	P0CG36	223 aa		10.93	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	CFC1	P0CG37	223 aa		10.93	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061		A0A0B4J2C4	111 aa		10.92	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	FXYD2	P54710	66 aa		10.92	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	C6orf99	Q4VX62	202 aa		10.92	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	RAB37	Q96AX2	223 aa		10.92	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	TSTD3	H0UI37	97 aa		10.91	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		10.91	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		10.9	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		10.9	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		10.9	□□□□□ -0.66
ILF3-223	ENST00000593061	COX7B	P24311	80 aa		10.89	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		10.89	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061		A0A1B0GWB2	263 aa		10.87	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		10.87	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		10.86	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		10.86	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061	VAMP3	Q15836	100 aa		10.85	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061		H7C2G1	150 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061		Q8N377	158 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ILF3-223	ENST00000593061	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
ILF3-223	ENST00000593061		M0R143	59 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ILF3-223	ENST00000593061		Q1RN00	199 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ILF3-223	ENST00000593061		K7ERJ3	54 aa		10.79	□□□□□ -0.68

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