RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590499.1

SMAD4-211, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-211ENST00000590499 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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SMAD4-211ENST00000590499 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.63□□□□□ -1.35
SMAD4-211ENST00000590499 DAND5Q8N907 189 aa6.63□□□□□ -1.35
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SMAD4-211ENST00000590499 C3orf79P0CE67 100 aa6.62□□□□□ -1.35
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SMAD4-211ENST00000590499 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa6.53□□□□□ -1.36
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SMAD4-211ENST00000590499 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.51□□□□□ -1.37
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SMAD4-211ENST00000590499 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.41□□□□□ -1.38
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SMAD4-211ENST00000590499 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-211ENST00000590499 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.37□□□□□ -1.39
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SMAD4-211ENST00000590499 SCGB1D1O95968 90 aa6.36□□□□□ -1.39
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