RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00167Q96N53 147 aa3.77□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.76□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 CFC1BP0CG36 223 aa3.76□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 CFC1P0CG37 223 aa3.76□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 IFITM1P13164 125 aa3.76□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 PCP4P48539 62 aa3.76□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZVH6 145 aa3.76□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.76□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.76□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.76□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 A6NDN8 102 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 M0R378 163 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2BP63146 152 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 TAL2Q16559 108 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB37Q96AX2 223 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 PKD1P98161 4303 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.75□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFC2O95298 119 aa3.74□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.74□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.73□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 EPM2AB3EWF7 344 aa3.73□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.73□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.73□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.73□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0B4J2C4 111 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 M0R143 59 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPAN13O95857 204 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV6-57P01721 117 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 PRLHP81277 87 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.72□□□□□ -1.81
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.71□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.71□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 Q1RN00 199 aa3.71□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf99Q4VX62 202 aa3.71□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 C1orf137Q5JT78 98 aa3.71□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.71□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.71□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.71□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GWB2 263 aa3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 REG3GQ6UW15 175 aa3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 COPS9Q8WXC6 57 aa3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM126AQ9H061 195 aa3.7□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 PRYO14603 147 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 TAX1BP3O14907 124 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIAP1O43715 76 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMB2P49721 201 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC2BQ92478 149 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.69□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 B5MCH6 92 aa3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BUT2 72 aa3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK2AP2O75956 126 aa3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 ERC2-IT1O76042 136 aa3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 COX7BP24311 80 aa3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 Q5VSD8 79 aa3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 DIRC1Q969H9 104 aa3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.68□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.67□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 BCE1O60756 84 aa3.67□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV7-43P04211 117 aa3.67□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 SPRR1AP35321 89 aa3.67□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL28P46779 137 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2AP49459 152 aa3.67□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.67□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 Q9BRP9 147 aa3.67□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.67□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.66□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 PKHD1P08F94 4074 aa3.65□□□□□ -1.82
CAPNS1-208ENST00000589162 TCL1BO95988 128 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZRX8 168 aa3.65□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00575Q6W349 94 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 MTURNQ8N3F0 131 aa3.64□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.64□□□□□ -1.83
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