RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584944.5

TRAF4-215, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-215ENST00000584944 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF861PO60384 105 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF4-215ENST00000584944 SMIM6P0DI80 62 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF4-215ENST00000584944 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAF4-215ENST00000584944 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAF4-215ENST00000584944 HIGD1BQ9P298 99 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAF4-215ENST00000584944 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV6-57P01721 117 aa8.48□□□□□ -1.05
TRAF4-215ENST00000584944 PRLHP81277 87 aa8.48□□□□□ -1.05
TRAF4-215ENST00000584944 OXTP01178 125 aa8.47□□□□□ -1.05
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.46□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 A4D1N5 150 aa8.46□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 A6NJY4 79 aa8.46□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 H0Y9J4 135 aa8.46□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.46□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 TAL2Q16559 108 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.45□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 RAB37Q96AX2 223 aa8.44□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 C12orf57Q99622 126 aa8.44□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.43□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 HSD52Q0P140 79 aa8.42□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 TSTD3H0UI37 97 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 SPRR1AP35321 89 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 VAMP3Q15836 100 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 CEND1Q8N111 149 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 PRO1933Q9H354 126 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.41□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 Q6ZRX8 168 aa8.4□□□□□ -1.06
TRAF4-215ENST00000584944 B5MCH6 92 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 H7C2G1 150 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 COX7BP24311 80 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 Q1RN00 199 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 C6orf99Q4VX62 202 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.37□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 SLC25A20O43772 301 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 LINC01600Q96MT4 127 aa8.36□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 A0A0B4J2C4 111 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1B0GWB2 263 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 SNCGO76070 127 aa8.35□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 CFC1BP0CG36 223 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 CFC1P0CG37 223 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 CRYGAP11844 174 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.34□□□□□ -1.07
TRAF4-215ENST00000584944 M0R143 59 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 MT1HL1P0DM35 61 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 FXYD2P54710 66 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.33□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 Q9BRP9 147 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 TNXBP22105 4242 aa8.31□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 PSMB2P49721 201 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 CTAG1AP78358 180 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 SPRR4Q96PI1 79 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.29□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 ERC2-IT1O76042 136 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.28□□□□□ -1.08
TRAF4-215ENST00000584944 K7ERJ3 54 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 COX6CP09669 75 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.27□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 hADV29S1A0JD25 119 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 H0YGX0 51 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 LRP2P98164 4655 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 BATFQ16520 125 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00575Q6W349 94 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 A0A087X002 238 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.22□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.22□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP10-8P60410 259 aa8.22□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.22□□□□□ -1.09
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00483Q53H64 154 aa8.21□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 GHRHP01286 108 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 F8WEM9 126 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 TRIAP1O43715 76 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 TSPAN13O95857 204 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 DNAL4O96015 105 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 MOBPQ13875 183 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 Q6ZQY7 126 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.18□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.17□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.17□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.16□□□□□ -1.1
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