RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584558.5

ITGB4-212, Transcript of integrin subunit beta 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGB4, Length 2,895 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4-212ENST00000584558 TGP01266 2768 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 DEFB130BP0DP73 79 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 DEFB130AP0DP74 79 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 PRR15Q8IV56 129 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 IGKV4-1P06312 121 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 LYRM9A8MSI8 78 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 Q8NAQ8 132 aa8.52□□□□□ -1.04
ITGB4-212ENST00000584558 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.52□□□□□ -1.05
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ITGB4-212ENST00000584558 KRTAP10-11P60412 298 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 C10orf25Q5T742 122 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 IGLV6-57P01721 117 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 GYPEP15421 78 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 DIRC1Q969H9 104 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 COL7A1Q02388 2944 aa8.51□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 hDV103S1A0JD37 113 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 COX7BP24311 80 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 DEFB4AO15263 64 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 Q6ZRP5 223 aa8.5□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 C3orf84H3BNL1 204 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 H3BQ85 93 aa8.49□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 PRO0255Q9UI72 69 aa8.49□□□□□ -1.05
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ITGB4-212ENST00000584558 A0A1B0GUV1 79 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.47□□□□□ -1.05
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ITGB4-212ENST00000584558 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 KLK12Q9UKR0 248 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 SMIM29Q86T20 159 aa8.47□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
ITGB4-212ENST00000584558 SPAG11BQ08648 103 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGB4-212ENST00000584558 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGB4-212ENST00000584558 PRR4Q16378 134 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB4-212ENST00000584558 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ITGB4-212ENST00000584558 Q1T7F1 81 aa8.45□□□□□ -1.06
ITGB4-212ENST00000584558 REG3AQ06141 175 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGB4-212ENST00000584558 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.44□□□□□ -1.06
ITGB4-212ENST00000584558 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB4-212ENST00000584558 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB4-212ENST00000584558 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ITGB4-212ENST00000584558 RETNQ9HD89 108 aa8.42□□□□□ -1.06
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ITGB4-212ENST00000584558 A8MU10 97 aa8.4□□□□□ -1.07
ITGB4-212ENST00000584558 A8MUN3 132 aa8.38□□□□□ -1.07
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ITGB4-212ENST00000584558 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.36□□□□□ -1.07
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ITGB4-212ENST00000584558 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.34□□□□□ -1.07
ITGB4-212ENST00000584558 PSCAO43653 123 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 SYCNQ0VAF6 134 aa8.33□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 LCE6AA0A183 80 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 LELP1Q5T871 98 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 H3BNG1 76 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.32□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 VPREB1P12018 145 aa8.31□□□□□ -1.08
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ITGB4-212ENST00000584558 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.3□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 Q5VV11 94 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.29□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 M0R378 163 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 UBE2BP63146 152 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.28□□□□□ -1.08
ITGB4-212ENST00000584558 K7EQZ3 153 aa8.28□□□□□ -1.08
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ITGB4-212ENST00000584558 PRR34Q9NV39 138 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 K7EIL1 84 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 Q8N377 158 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.27□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 A0A1W2PNM2 257 aa8.26□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 DSCR10P59022 87 aa8.25□□□□□ -1.09
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ITGB4-212ENST00000584558 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 UBE2AP49459 152 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 C16orf90A8MZG2 172 aa8.24□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 C1orf137Q5JT78 98 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 PRR15LQ9BU68 103 aa8.23□□□□□ -1.09
ITGB4-212ENST00000584558 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.23□□□□□ -1.09
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