RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		15.07	■□□□□ 0
GPS1-223	ENST00000584229	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		15.07	■□□□□ 0
GPS1-223	ENST00000584229	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		15.07	■□□□□ 0
GPS1-223	ENST00000584229	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		15.07	■□□□□ 0
GPS1-223	ENST00000584229	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
GPS1-223	ENST00000584229		A6NDN8	102 aa		15.05	■□□□□ -0
GPS1-223	ENST00000584229	SPRR1A	P35321	89 aa		15.05	■□□□□ -0
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
GPS1-223	ENST00000584229	LINC01600	Q96MT4	127 aa		15.02	■□□□□ -0
GPS1-223	ENST00000584229		A4D1N5	150 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GPS1-223	ENST00000584229	HIGD1B	Q9P298	99 aa		15.01	□□□□□ -0.01
GPS1-223	ENST00000584229	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
GPS1-223	ENST00000584229	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		15	□□□□□ -0.01
GPS1-223	ENST00000584229		B5MCH6	92 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
GPS1-223	ENST00000584229	C12orf57	Q99622	126 aa		14.99	□□□□□ -0.01
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		14.98	□□□□□ -0.01
GPS1-223	ENST00000584229	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		14.95	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229		Q6ZRX8	168 aa		14.95	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229	MT1HL1	P0DM35	61 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229	C6orf99	Q4VX62	202 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM6	P0DI80	62 aa		14.91	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		14.91	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229	TAL2	Q16559	108 aa		14.9	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
GPS1-223	ENST00000584229	COX7B	P24311	80 aa		14.89	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229		Q9BRP9	147 aa		14.89	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	CEND1	Q8N111	149 aa		14.88	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		14.87	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		14.87	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	RAB37	Q96AX2	223 aa		14.87	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	PRO1933	Q9H354	126 aa		14.87	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	ERC2-IT1	O76042	136 aa		14.85	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	CRYGA	P11844	174 aa		14.85	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP10-8	P60410	259 aa		14.85	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	SPRR4	Q96PI1	79 aa		14.85	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		14.84	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229		A6NJY4	79 aa		14.84	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229	HSD52	Q0P140	79 aa		14.84	□□□□□ -0.03
GPS1-223	ENST00000584229		A0A087X002	238 aa		14.83	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229		H7C2G1	150 aa		14.83	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229	TNXB	P22105	4242 aa		14.82	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GWB2	263 aa		14.81	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229	CFC1B	P0CG36	223 aa		14.81	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229	CFC1	P0CG37	223 aa		14.81	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		14.81	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		14.81	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		14.81	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229	FXYD2	P54710	66 aa		14.8	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		14.79	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0B4J2C4	111 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		14.78	□□□□□ -0.04
GPS1-223	ENST00000584229	VAMP3	Q15836	100 aa		14.77	□□□□□ -0.05
GPS1-223	ENST00000584229		Q1RN00	199 aa		14.76	□□□□□ -0.05
GPS1-223	ENST00000584229	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		14.75	□□□□□ -0.05
GPS1-223	ENST00000584229	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		14.73	□□□□□ -0.05
GPS1-223	ENST00000584229	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		14.71	□□□□□ -0.05
GPS1-223	ENST00000584229	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		14.71	□□□□□ -0.05
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A20	O43772	301 aa		14.7	□□□□□ -0.06
GPS1-223	ENST00000584229	TSTD3	H0UI37	97 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00483	Q53H64	154 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GPS1-223	ENST00000584229	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		14.69	□□□□□ -0.06
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		14.68	□□□□□ -0.06
GPS1-223	ENST00000584229		K7ERJ3	54 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GPS1-223	ENST00000584229	HERC1	Q15751	4861 aa		14.67	□□□□□ -0.06
GPS1-223	ENST00000584229	CTAG1A	P78358	180 aa		14.64	□□□□□ -0.07
GPS1-223	ENST00000584229	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		14.62	□□□□□ -0.07
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00575	Q6W349	94 aa		14.62	□□□□□ -0.07
GPS1-223	ENST00000584229	hADV29S1	A0JD25	119 aa		14.61	□□□□□ -0.07
GPS1-223	ENST00000584229	MOBP	Q13875	183 aa		14.61	□□□□□ -0.07
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		14.61	□□□□□ -0.07
GPS1-223	ENST00000584229		M0R143	59 aa		14.59	□□□□□ -0.07
GPS1-223	ENST00000584229	TSPAN13	O95857	204 aa		14.59	□□□□□ -0.07
GPS1-223	ENST00000584229	PSMB2	P49721	201 aa		14.58	□□□□□ -0.08
GPS1-223	ENST00000584229	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		14.57	□□□□□ -0.08
GPS1-223	ENST00000584229	SPRR1B	P22528	89 aa		14.56	□□□□□ -0.08
GPS1-223	ENST00000584229		Q8NBF4	154 aa		14.56	□□□□□ -0.08
GPS1-223	ENST00000584229	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		14.56	□□□□□ -0.08
GPS1-223	ENST00000584229		Q6ZQY7	126 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GPS1-223	ENST00000584229		H0YGX0	51 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GPS1-223	ENST00000584229	TRIAP1	O43715	76 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GPS1-223	ENST00000584229	SNCG	O76070	127 aa		14.53	□□□□□ -0.08
GPS1-223	ENST00000584229	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GPS1-223	ENST00000584229	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
GPS1-223	ENST00000584229	BATF	Q16520	125 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GPS1-223	ENST00000584229	COX6C	P09669	75 aa		14.48	□□□□□ -0.09
GPS1-223	ENST00000584229	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
GPS1-223	ENST00000584229	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		14.48	□□□□□ -0.09
GPS1-223	ENST00000584229	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		14.48	□□□□□ -0.09
GPS1-223	ENST00000584229		Q8N377	158 aa		14.47	□□□□□ -0.09
GPS1-223	ENST00000584229	CLEC2B	Q92478	149 aa		14.46	□□□□□ -0.09

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