RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 PCP2Q8IVA1 136 aa16.62■□□□□ 0.25
NOMO3-217ENST00000576589 B5MCH6 92 aa16.6■□□□□ 0.25
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa16.6■□□□□ 0.25
NOMO3-217ENST00000576589 SMCR5Q8TEV8 140 aa16.6■□□□□ 0.25
NOMO3-217ENST00000576589 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa16.59■□□□□ 0.25
NOMO3-217ENST00000576589 SPANXDQ9BXN6 97 aa16.59■□□□□ 0.25
NOMO3-217ENST00000576589 SPRR4Q96PI1 79 aa16.58■□□□□ 0.24
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NOMO3-217ENST00000576589 C5orf52A6NGY3 159 aa16.56■□□□□ 0.24
NOMO3-217ENST00000576589 HSBP1L1C9JCN9 74 aa16.56■□□□□ 0.24
NOMO3-217ENST00000576589 OR13C6PQ8NH95 151 aa16.56■□□□□ 0.24
NOMO3-217ENST00000576589 CBY1Q9Y3M2 126 aa16.54■□□□□ 0.24
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
NOMO3-217ENST00000576589 Q6ZRX8 168 aa16.53■□□□□ 0.24
NOMO3-217ENST00000576589 LINC00518Q8N0U6 118 aa16.52■□□□□ 0.24
NOMO3-217ENST00000576589 COPS9Q8WXC6 57 aa16.52■□□□□ 0.24
NOMO3-217ENST00000576589 IFITM1P13164 125 aa16.51■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 Q6ZVH6 145 aa16.51■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 TSPAN13O95857 204 aa16.5■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 SCGB1D1O95968 90 aa16.5■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 Q9BRP9 147 aa16.5■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 ERC2-IT1O76042 136 aa16.48■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 C3orf22Q8N5N4 141 aa16.48■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 PPDPFQ9H3Y8 114 aa16.47■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 MUSTN1Q8IVN3 82 aa16.46■□□□□ 0.23
NOMO3-217ENST00000576589 LINC00304Q8N9R0 145 aa16.45■□□□□ 0.22
NOMO3-217ENST00000576589 GAGE2AQ6NT46 116 aa16.44■□□□□ 0.22
NOMO3-217ENST00000576589 LINC00483Q53H64 154 aa16.41■□□□□ 0.22
NOMO3-217ENST00000576589 PRR4Q16378 134 aa16.38■□□□□ 0.21
NOMO3-217ENST00000576589 A6NDN8 102 aa16.36■□□□□ 0.21
NOMO3-217ENST00000576589 C6orf99Q4VX62 202 aa16.36■□□□□ 0.21
NOMO3-217ENST00000576589 LPAP08519 4548 aa16.34■□□□□ 0.21
NOMO3-217ENST00000576589 COX7BP24311 80 aa16.33■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa16.31■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa16.31■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa16.3■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 COX8AP10176 69 aa16.3■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 CTAG1AP78358 180 aa16.29■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 SPAG11AQ6PDA7 123 aa16.29■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 Q8NBF4 154 aa16.29■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa16.28■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 C4orf48Q5BLP8 95 aa16.27■□□□□ 0.2
NOMO3-217ENST00000576589 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa16.26■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 MOBPQ13875 183 aa16.26■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 A4D1N5 150 aa16.24■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 DLEU1O43261 78 aa16.24■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 PAM16Q9Y3D7 125 aa16.24■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 SPATA45Q537H7 98 aa16.23■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 RETNLBQ9BQ08 111 aa16.23■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa16.22■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 C14orf144Q96I85 54 aa16.22■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 HIST1H4GQ99525 98 aa16.22■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 A0A1B0GWB2 263 aa16.21■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 SMIM11BQ8TCY0 68 aa16.21■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 VAMP8Q9BV40 100 aa16.21■□□□□ 0.19
NOMO3-217ENST00000576589 SPRR1BP22528 89 aa16.17■□□□□ 0.18
NOMO3-217ENST00000576589 C9orf153Q5TBE3 101 aa16.17■□□□□ 0.18
NOMO3-217ENST00000576589 SPINK1P00995 79 aa16.15■□□□□ 0.18
NOMO3-217ENST00000576589 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NOMO3-217ENST00000576589 TAL2Q16559 108 aa16.14■□□□□ 0.17
NOMO3-217ENST00000576589 SLC25A34Q6PIV7 304 aa16.14■□□□□ 0.17
NOMO3-217ENST00000576589 DEFB105AQ8NG35 78 aa16.13■□□□□ 0.17
NOMO3-217ENST00000576589 C12orf57Q99622 126 aa16.13■□□□□ 0.17
NOMO3-217ENST00000576589 HIGD1BQ9P298 99 aa16.11■□□□□ 0.17
NOMO3-217ENST00000576589 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa16.1■□□□□ 0.17
NOMO3-217ENST00000576589 VAMP3Q15836 100 aa16.09■□□□□ 0.17
NOMO3-217ENST00000576589 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
NOMO3-217ENST00000576589 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-217ENST00000576589 PYY3Q5JQD4 70 aa16.07■□□□□ 0.16
NOMO3-217ENST00000576589 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-217ENST00000576589 C2orf91Q6ZV80 131 aa16.06■□□□□ 0.16
NOMO3-217ENST00000576589 SLC25A20O43772 301 aa16.03■□□□□ 0.16
NOMO3-217ENST00000576589 RPS29P62273 56 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NOMO3-217ENST00000576589 Q1RN00 199 aa16.03■□□□□ 0.16
NOMO3-217ENST00000576589 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa16.02■□□□□ 0.16
NOMO3-217ENST00000576589 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 LINC00575Q6W349 94 aa16.01■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 CFC1BP0CG36 223 aa15.99■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 CFC1P0CG37 223 aa15.99■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 SMIM29Q86T20 159 aa15.98■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 RAB37Q96AX2 223 aa15.98■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 MUC2Q02817 5179 aa15.97■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 TPRXLQ17RH7 258 aa15.97■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 Q8N377 158 aa15.97■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 H7C2G1 150 aa15.96■□□□□ 0.15
NOMO3-217ENST00000576589 CEND1Q8N111 149 aa15.95■□□□□ 0.14
NOMO3-217ENST00000576589 hADV29S1A0JD25 119 aa15.94■□□□□ 0.14
NOMO3-217ENST00000576589 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa15.94■□□□□ 0.14
NOMO3-217ENST00000576589 A0A0B4J2C4 111 aa15.93■□□□□ 0.14
NOMO3-217ENST00000576589 HRCT1Q6UXD1 115 aa15.92■□□□□ 0.14
NOMO3-217ENST00000576589 PRO1933Q9H354 126 aa15.92■□□□□ 0.14
NOMO3-217ENST00000576589 CDIP1Q9H305 208 aa15.91■□□□□ 0.14
NOMO3-217ENST00000576589 Q6ZQY7 126 aa15.89■□□□□ 0.13
NOMO3-217ENST00000576589 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa15.88■□□□□ 0.13
NOMO3-217ENST00000576589 A6NJY4 79 aa15.88■□□□□ 0.13
NOMO3-217ENST00000576589 FXYD2P54710 66 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms