RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561668.5

PKD1-223, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 3

Gene PKD1, Length 665 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKD1-223	ENST00000561668	COPS9	Q8WXC6	57 aa		11.09	□□□□□ -0.63
PKD1-223	ENST00000561668	DLEU1	O43261	78 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		11.08	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668		A0A087X002	238 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668	COX8A	P10176	69 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		11.07	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		11.06	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668		B5MCH6	92 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		11.05	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		11.04	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		11.03	□□□□□ -0.64
PKD1-223	ENST00000561668	TSPAN13	O95857	204 aa		11.02	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	PYY3	Q5JQD4	70 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668		Q6ZRX8	168 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		11.01	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	SPATA45	Q537H7	98 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	VAMP8	Q9BV40	100 aa		10.99	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	PRR4	Q16378	134 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	SPRR4	Q96PI1	79 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668		Q9BRP9	147 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	HIGD1B	Q9P298	99 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		10.98	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		10.97	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	C14orf144	Q96I85	54 aa		10.96	□□□□□ -0.65
PKD1-223	ENST00000561668	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		10.94	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		10.94	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		10.94	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	ERC2-IT1	O76042	136 aa		10.93	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00483	Q53H64	154 aa		10.93	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		10.93	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		10.93	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668		A4D1N5	150 aa		10.92	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		10.92	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	C6orf99	Q4VX62	202 aa		10.9	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668	HIST1H4G	Q99525	98 aa		10.9	□□□□□ -0.66
PKD1-223	ENST00000561668		A6NDN8	102 aa		10.89	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.89	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		10.89	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	CTAG1A	P78358	180 aa		10.88	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		10.88	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	LRP2	P98164	4655 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	TAL2	Q16559	108 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	COX7B	P24311	80 aa		10.86	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		10.86	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668		A0A1B0GWB2	263 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	SPRR1B	P22528	89 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PKD1-223	ENST00000561668	CFC1B	P0CG36	223 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PKD1-223	ENST00000561668	CFC1	P0CG37	223 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PKD1-223	ENST00000561668	CEND1	Q8N111	149 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKD1-223	ENST00000561668	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKD1-223	ENST00000561668	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKD1-223	ENST00000561668		A0A0B4J2C4	111 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKD1-223	ENST00000561668		Q8NBF4	154 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKD1-223	ENST00000561668	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKD1-223	ENST00000561668	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	C12orf57	Q99622	126 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		10.76	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	LPA	P08519	4548 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	SPINK1	P00995	79 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	MOBP	Q13875	183 aa		10.75	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	VAMP3	Q15836	100 aa		10.74	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	FXYD2	P54710	66 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	HSD52	Q0P140	79 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	LINC00575	Q6W349	94 aa		10.73	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668		A6NJY4	79 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		10.72	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	SMIM6	P0DI80	62 aa		10.71	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		10.71	□□□□□ -0.69
PKD1-223	ENST00000561668	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		10.7	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	RAB37	Q96AX2	223 aa		10.7	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		10.69	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	SMIM29	Q86T20	159 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	CDIP1	Q9H305	208 aa		10.68	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	SLC25A20	O43772	301 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		10.67	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	hADV29S1	A0JD25	119 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668		Q8N377	158 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PKD1-223	ENST00000561668		H0YGX0	51 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PKD1-223	ENST00000561668	TPRXL	Q17RH7	258 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PKD1-223	ENST00000561668		H7C2G1	150 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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