RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.9□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.9□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 ATOH7Q8N100 152 aa4.9□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 NMUP48645 174 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.89□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 A0A087X002 238 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.88□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 ZNF815PA8K554 130 aa4.87□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.87□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.87□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.87□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.86□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.86□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 LITAFQ99732 161 aa4.86□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.86□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 C20orf202A1L168 122 aa4.85□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 PRYO14603 147 aa4.85□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 S100A2P29034 98 aa4.85□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 DDTP30046 118 aa4.85□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.85□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.84□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 TSPAN13O95857 204 aa4.84□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 S100A6P06703 90 aa4.84□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 CRYGAP11844 174 aa4.84□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 SPRR1AP35321 89 aa4.84□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.84□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.84□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 PCP2Q8IVA1 136 aa4.84□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.84□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.84□□□□□ -1.63
LINS1-211ENST00000560941 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.83□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 NDUFC2O95298 119 aa4.83□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.83□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 B5MCH6 92 aa4.82□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 TIMM17BO60830 172 aa4.82□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 ERC2-IT1O76042 136 aa4.82□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.82□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.82□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.82□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.82□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.82□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 IGLV6-57P01721 117 aa4.81□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 S100A12P80511 92 aa4.81□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 SPRR4Q96PI1 79 aa4.81□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 LRP2P98164 4655 aa4.8□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.8□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 Q9BRP9 147 aa4.8□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 SPANXCQ9NY87 97 aa4.8□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.8□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 LPAP08519 4548 aa4.8□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 C5orf52A6NGY3 159 aa4.79□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 SCGB1D1O95968 90 aa4.79□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.79□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.79□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.79□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.79□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.79□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.78□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 PRR4Q16378 134 aa4.78□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 Q6ZRX8 168 aa4.78□□□□□ -1.64
LINS1-211ENST00000560941 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.77□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.77□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.77□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 AKR1D1P51857 326 aa4.76□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.75□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 A6NDN8 102 aa4.75□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 IFITM1P13164 125 aa4.75□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 C6orf99Q4VX62 202 aa4.75□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.75□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 LINC00483Q53H64 154 aa4.74□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 Q8NBF4 154 aa4.74□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 COX7BP24311 80 aa4.73□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 MOBPQ13875 183 aa4.73□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 Q6ZVH6 145 aa4.73□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 C14orf144Q96I85 54 aa4.73□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 A4D1N5 150 aa4.72□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.72□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 COPS9Q8WXC6 57 aa4.72□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 C12orf57Q99622 126 aa4.72□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 PAM16Q9Y3D7 125 aa4.72□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.72□□□□□ -1.65
LINS1-211ENST00000560941 COX8AP10176 69 aa4.71□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 SPATA45Q537H7 98 aa4.71□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.71□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.7□□□□□ -1.66
LINS1-211ENST00000560941 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms