RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 CCL25O15444 150 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 FGF6P10767 208 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 HBBP68871 147 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 SS18Q15532 418 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 NUP35Q8NFH5 326 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 A6NED7 52 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 HIGD1CA8MV81 97 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 NUPR1O60356 82 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 BAGE3Q86Y29 109 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 BORCS7Q96B45 105 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 VAMP8Q9BV40 100 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.03□□□□□ -1.92
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 A0A096LNI7 61 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1B0GUT8 65 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 LINC01546A6NGU7 62 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 PPP1R17O96001 155 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00614P0C842 121 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 IGLC3P0DOY3 106 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 XCL1P47992 114 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 CARD19Q96LW7 228 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 ST20Q9HBF5 79 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa3.02□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM238C9JI98 176 aa3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 APOMO95445 188 aa3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 C3orf79P0CE67 100 aa3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 HRES1P13985 223 aa3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM191AQ9H0A3 160 aa3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 PRO1933Q9H354 126 aa3.01□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 COX7A2LO14548 114 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 PPBPP02775 128 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 FCER1GP30273 86 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 LINC01545Q5VT33 79 aa3□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 HSPB8Q9UJY1 196 aa3□□□□□ -1.93
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TMOD3-208ENST00000560725 DLEU1O43261 78 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 IGLV6-57P01721 117 aa2.99□□□□□ -1.93
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TMOD3-208ENST00000560725 C4orf26Q17RF5 130 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA45Q537H7 98 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 PMCHL2Q9BQD1 86 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.99□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 A0A1W2PNN7 141 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 K7EMI3 77 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 LEPROTL1O95214 131 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 KRTDAPP60985 99 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 DIRC1Q969H9 104 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 C20orf78Q9BR46 151 aa2.98□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa2.98□□□□□ -1.93
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TMOD3-208ENST00000560725 LINC01549A6NIU2 74 aa2.97□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf137Q5JT78 98 aa2.97□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 LCE3AQ5TA76 89 aa2.97□□□□□ -1.93
TMOD3-208ENST00000560725 C5orf38Q86SI9 138 aa2.97□□□□□ -1.93
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TMOD3-208ENST00000560725 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.97□□□□□ -1.93
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TMOD3-208ENST00000560725 NDUFA1O15239 70 aa2.96□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 HBDP02042 147 aa2.96□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 COX8AP10176 69 aa2.96□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 SEC11AP67812 179 aa2.96□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 SPAG11BQ08648 103 aa2.96□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 FAM19A2Q8N3H0 131 aa2.96□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.96□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.96□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 CKS2P33552 79 aa2.95□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 PRELID3AQ96N28 172 aa2.95□□□□□ -1.94
TMOD3-208ENST00000560725 HIGD1BQ9P298 99 aa2.95□□□□□ -1.94
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