RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560631.1

RNF31-222, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 2

Gene RNF31, Length 320 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-222	ENST00000560631	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	TNXB	P22105	4242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	PRY	O14603	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	SPRR1A	P35321	89 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	NCR3	O14931	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	IFITM1	P13164	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF31-222	ENST00000560631	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	DLEU1	O43261	78 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	DDT	P30046	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	UBE2A	P49459	152 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	COX8A	P10176	69 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	NPC2	P61916	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	S100A12	P80511	92 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631		B5MCH6	92 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	PRLH	P81277	87 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	HERC1	Q15751	4861 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RNF31-222	ENST00000560631	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631		Q6ZRX8	168 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	CRYGA	P11844	174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631		Q9BRP9	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631		A0A087X002	238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631		A4D1N5	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	CTAG1A	P78358	180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	TAL2	Q16559	108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631		A0A1B0GWB2	263 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631		A6NDN8	102 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RNF31-222	ENST00000560631	COX7B	P24311	80 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	CFC1	P0CG37	223 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	SPRR1B	P22528	89 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	CEND1	Q8N111	149 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631		A0A0B4J2C4	111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	VAMP3	Q15836	100 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RNF31-222	ENST00000560631	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.66	□□□□□ -1.66

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