RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	VPREB1	P12018	145 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	IFITM1	P13164	125 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	MT3	P25713	68 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	HERC2	O95714	4834 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	FAT1	Q14517	4588 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2B	P63146	152 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312		Q5VSD8	79 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NUMB-231	ENST00000559312		M0R378	163 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312		Q8NDZ9	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	DDT	P30046	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	NPC2	P61916	151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312		Q75L30	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	NCR3	O14931	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	TAL2	Q16559	108 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	BCE1	O60756	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NUMB-231	ENST00000559312		A4D1N5	150 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	SPRR1A	P35321	89 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312		H0Y9J4	135 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF861P	O60384	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	HSD52	Q0P140	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	CEND1	Q8N111	149 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312		A6NDN8	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2A	P49459	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312		A0A0B4J2C4	111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312		M0R143	59 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	CFC1	P0CG37	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	PRLH	P81277	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312		Q6ZRX8	168 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GV90	55 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	FXYD2	P54710	66 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUMB-231	ENST00000559312	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUMB-231	ENST00000559312	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUMB-231	ENST00000559312	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUMB-231	ENST00000559312	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUMB-231	ENST00000559312	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUMB-231	ENST00000559312		A0A1B0GWB2	263 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUMB-231	ENST00000559312	OXT	P01178	125 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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