RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 IFITM2Q01629 132 aa9.06□□□□□ -0.96
PRRX1-208ENST00000553786 LEPROTO15243 131 aa9.05□□□□□ -0.96
PRRX1-208ENST00000553786 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.05□□□□□ -0.96
PRRX1-208ENST00000553786 C5orf52A6NGY3 159 aa9.04□□□□□ -0.96
PRRX1-208ENST00000553786 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.03□□□□□ -0.96
PRRX1-208ENST00000553786 J3QQQ9 107 aa9.02□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.02□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 HSBP1O75506 76 aa9.01□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 SPRR1BP22528 89 aa9.01□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 NMUP48645 174 aa9.01□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 NPC2P61916 151 aa9.01□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 PLNP26678 52 aa9□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 HERVK_113P61574 105 aa9□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 CBY1Q9Y3M2 126 aa9□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.97□□□□□ -0.97
PRRX1-208ENST00000553786 H7C2G1 150 aa8.95□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 DPM2O94777 84 aa8.95□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 LEPROTL1O95214 131 aa8.95□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 CD164Q04900 197 aa8.95□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 APOC3P02656 99 aa8.94□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 Q1RN00 199 aa8.94□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.94□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.94□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.93□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 PRO1933Q9H354 126 aa8.93□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 A0A0J9YXY3 114 aa8.92□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 SNAPINO95295 136 aa8.92□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 IGKCP01834 107 aa8.91□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 TAL2Q16559 108 aa8.9□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 C1orf195Q5TG92 126 aa8.9□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 SVBPQ8N300 66 aa8.9□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.9□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 SPANXCQ9NY87 97 aa8.9□□□□□ -0.98
PRRX1-208ENST00000553786 COX7BP24311 80 aa8.89□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 NDUFA5Q16718 116 aa8.89□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 Q5XG85 94 aa8.89□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 YPEL4Q96NS1 127 aa8.89□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.89□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 SERF1AO75920 110 aa8.88□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 FABP4P15090 132 aa8.87□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.87□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.87□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.86□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 AKR1D1P51857 326 aa8.86□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 LINC00310P59036 64 aa8.86□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 C6orf99Q4VX62 202 aa8.86□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.84□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 E9PLD3 99 aa8.84□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 SMIM29Q86T20 159 aa8.84□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 LITAFQ99732 161 aa8.84□□□□□ -0.99
PRRX1-208ENST00000553786 A0A0G2JQZ4 141 aa8.83□□□□□ -1
PRRX1-208ENST00000553786 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRRX1-208ENST00000553786 TIMM17BO60830 172 aa8.81□□□□□ -1
PRRX1-208ENST00000553786 TRGC2P03986 189 aa8.81□□□□□ -1
PRRX1-208ENST00000553786 Q6Q795 121 aa8.8□□□□□ -1
PRRX1-208ENST00000553786 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.79□□□□□ -1
PRRX1-208ENST00000553786 TCL1BO95988 128 aa8.78□□□□□ -1
PRRX1-208ENST00000553786 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.77□□□□□ -1.01
PRRX1-208ENST00000553786 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.77□□□□□ -1.01
PRRX1-208ENST00000553786 A0A1B0GWB2 263 aa8.75□□□□□ -1.01
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF815PA8K554 130 aa8.75□□□□□ -1.01
PRRX1-208ENST00000553786 CFC1P0CG37 223 aa8.72□□□□□ -1.01
PRRX1-208ENST00000553786 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.71□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 PCP2Q8IVA1 136 aa8.71□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.71□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.7□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 A6NDN8 102 aa8.69□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 F8WEM9 126 aa8.69□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.69□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 A4D1N5 150 aa8.67□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 Q75L30 129 aa8.67□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.66□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 LINC01545Q5VT33 79 aa8.65□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 COPS9Q8WXC6 57 aa8.65□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.65□□□□□ -1.02
PRRX1-208ENST00000553786 USH2AO75445 5202 aa8.65□□□□□ -1.03
PRRX1-208ENST00000553786 SSPOA2VEC9 5147 aa8.64□□□□□ -1.03
PRRX1-208ENST00000553786 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.62□□□□□ -1.03
PRRX1-208ENST00000553786 IFITM1P13164 125 aa8.62□□□□□ -1.03
PRRX1-208ENST00000553786 C20orf202A1L168 122 aa8.61□□□□□ -1.03
PRRX1-208ENST00000553786 Q6JHZ5 121 aa8.61□□□□□ -1.03
PRRX1-208ENST00000553786 PET117Q6UWS5 81 aa8.61□□□□□ -1.03
PRRX1-208ENST00000553786 CLEC2BQ92478 149 aa8.61□□□□□ -1.03
PRRX1-208ENST00000553786 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.6□□□□□ -1.03
PRRX1-208ENST00000553786 IGFL1Q6UW32 110 aa8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-208ENST00000553786 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.58□□□□□ -1.04
PRRX1-208ENST00000553786 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-208ENST00000553786 Q6ZVH6 145 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-208ENST00000553786 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-208ENST00000553786 Q96NJ1 140 aa8.57□□□□□ -1.04
PRRX1-208ENST00000553786 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms