RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 Q96NJ1 140 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 WFDC2Q14508 124 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 MGAQ8IWI9 3026 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 GAS8-AS1O95177 125 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00208Q96KT6 92 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 BRK1Q8WUW1 75 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 EYSQ5T1H1 3165 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 H0Y9P7 68 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 Q6ZSA8 131 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 VCANP13611 3396 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 C15orf56Q8N910 161 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 ACYP2P14621 99 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00310P59036 64 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 MT-ATP8P03928 68 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV6-57P01721 117 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 SPRR4Q96PI1 79 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 USP24Q9UPU5 2620 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 ATRQ13535 2644 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 Q5VSD8 79 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 A8MWP4 228 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 STAB1Q9NY15 2570 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 M0R2T5 61 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 ITPR3Q14573 2671 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 Q9UF83 564 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 A0A096LNJ9 63 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 Q8N3U1 123 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00846Q9NV44 126 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GVX0 72 aa5.18□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 PCOTHQ58A44 107 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 COX7CP15954 63 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 CFAP54Q96N23 3096 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 CR1P17927 2039 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 A6NED7 52 aa5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 FAM168BA1KXE4 195 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 FRYLO94915 3013 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PNN7 141 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 Q6ZR54 194 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 Q6ZQT0 140 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 IGFL1Q6UW32 110 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 C9orf92A6NGG3 77 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 PRR15Q8IV56 129 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 HRES1P13985 223 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GU69 56 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 CENPEQ02224 2701 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 SPEGQ15772 3267 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 USP34Q70CQ2 3546 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 DSCR10P59022 87 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 FRYQ5TBA9 3013 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 A8MUN3 132 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 SNURFQ9Y675 71 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM29Q86T20 159 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 Q8N1X5 172 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 Q8N377 158 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 ERC2-IT1O76042 136 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms