RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 Q96NJ1 140 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 WFDC2Q14508 124 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 MGAQ8IWI9 3026 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 GAS8-AS1O95177 125 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00208Q96KT6 92 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 BRK1Q8WUW1 75 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRB-209ENST00000550857 H0Y9P7 68 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-209ENST00000550857 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRB-209ENST00000550857 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRB-209ENST00000550857 C15orf56Q8N910 161 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRB-209ENST00000550857 LINC00310P59036 64 aa5.27□□□□□ -1.57
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PTPRB-209ENST00000550857 IGLV6-57P01721 117 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 SPRR4Q96PI1 79 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 USP24Q9UPU5 2620 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 ATRQ13535 2644 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 Q5VSD8 79 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 A8MWP4 228 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 STAB1Q9NY15 2570 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-209ENST00000550857 M0R2T5 61 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 ITPR3Q14573 2671 aa5.21□□□□□ -1.58
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PTPRB-209ENST00000550857 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 Q9UF83 564 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRB-209ENST00000550857 Q8N3U1 123 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00846Q9NV44 126 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRB-209ENST00000550857 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
PTPRB-209ENST00000550857 FAM168BA1KXE4 195 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.15□□□□□ -1.59
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PTPRB-209ENST00000550857 FRYQ5TBA9 3013 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-209ENST00000550857 A8MUN3 132 aa5.08□□□□□ -1.6
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PTPRB-209ENST00000550857 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 SMIM29Q86T20 159 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 Q8N1X5 172 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 Q8N377 158 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-209ENST00000550857 ERC2-IT1O76042 136 aa5.04□□□□□ -1.6
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