RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542570.5

TOP3A-208, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3A, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-208ENST00000542570 PRR34Q9NV39 138 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 C15orf56Q8N910 161 aa6.73□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 A0A087WVE0 104 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 BPY2O14599 106 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 ACYP1P07311 99 aa6.72□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00575Q6W349 94 aa6.71□□□□□ -1.33
TOP3A-208ENST00000542570 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 NDUFC2O95298 119 aa6.71□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 A0A0G2JQZ4 141 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 A0A1W2PNN7 141 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00643Q86TS7 51 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 UPK3BQ9BT76 320 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.69□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 CCDC179H3BU77 68 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 Q8N9L7 120 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 PRO0461Q9UI25 63 aa6.68□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 WIPF1O43516 503 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00846Q9NV44 126 aa6.67□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 RTL8CO15255 209 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 VPREB1P12018 145 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 APLNQ9ULZ1 77 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.66□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TOP3A-208ENST00000542570 A0A087WSZ3 146 aa6.65□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 Q9BRP9 147 aa6.65□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 NDUFB1O75438 58 aa6.64□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 CDIP1Q9H305 208 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.63□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 PDE6GP18545 87 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 C20orf197Q8N268 126 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.62□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.61□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 Q8NDZ9 215 aa6.61□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 C16orf90A8MZG2 172 aa6.6□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 EPM2AB3EWF7 344 aa6.6□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 PRR4Q16378 134 aa6.6□□□□□ -1.35
TOP3A-208ENST00000542570 PRYO14603 147 aa6.59□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 A0A087WTM6 91 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 SNURFQ9Y675 71 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 H3BQ85 93 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV6-57P01721 117 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 TNP2Q05952 138 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.58□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 ATOX1O00244 68 aa6.57□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 Q6ZRX8 168 aa6.57□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 ERC2-IT1O76042 136 aa6.57□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 MOBPQ13875 183 aa6.56□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.56□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 Q6ZVQ6 151 aa6.56□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 IGKV4-1P06312 121 aa6.55□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.54□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.54□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 Q6JHZ5 121 aa6.54□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 F8WDY8 70 aa6.53□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.53□□□□□ -1.36
TOP3A-208ENST00000542570 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.52□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.51□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 AKAP9Q99996 3911 aa6.51□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 UQCRQO14949 82 aa6.5□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 MP68P56378 58 aa6.5□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.5□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 C5orf47Q569G3 176 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 J3KT08 172 aa6.49□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 Q8N377 158 aa6.48□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 Q6ZQT0 140 aa6.47□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.47□□□□□ -1.37
TOP3A-208ENST00000542570 BCE1O60756 84 aa6.46□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 Q6Q795 121 aa6.46□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.45□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.45□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 IMUPQ9GZP8 106 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 COX7CP15954 63 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.44□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 SERP2Q8N6R1 65 aa6.43□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 PANO1I0J062 215 aa6.43□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00208Q96KT6 92 aa6.42□□□□□ -1.38
TOP3A-208ENST00000542570 Q8NBF4 154 aa6.42□□□□□ -1.38
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