RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 ITPR2Q14571 2701 aa3.15□□□□□ -1.9
TRDN-204ENST00000542443 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 J3QLI3 93 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 MSMBP08118 114 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 KIAA0087Q14695 138 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 LY6EQ16553 131 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 LINC00575Q6W349 94 aa3.15□□□□□ -1.91
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TRDN-204ENST00000542443 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.15□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 TMEM86BQ8N661 226 aa3.15□□□□□ -1.91
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TRDN-204ENST00000542443 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.14□□□□□ -1.91
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TRDN-204ENST00000542443 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.14□□□□□ -1.91
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TRDN-204ENST00000542443 C19orf84I3L1E1 186 aa3.14□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 LINC00158P58513 81 aa3.14□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 ENHOQ6UWT2 76 aa3.14□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 C20orf197Q8N268 126 aa3.14□□□□□ -1.91
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TRDN-204ENST00000542443 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 B4DSR2 109 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 Q8N9L7 120 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 CREBBPQ92793 2442 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.13□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GW54 56 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 IGLV6-57P01721 117 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 PRM2P04554 102 aa3.12□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP10-1P60331 282 aa3.12□□□□□ -1.91
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TRDN-204ENST00000542443 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 Q6ZTI0 123 aa3.12□□□□□ -1.91
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TRDN-204ENST00000542443 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.11□□□□□ -1.91
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TRDN-204ENST00000542443 RETNQ9HD89 108 aa3.11□□□□□ -1.91
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TRDN-204ENST00000542443 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.09□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 Q8NDZ9 215 aa3.09□□□□□ -1.91
TRDN-204ENST00000542443 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.09□□□□□ -1.91
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TRDN-204ENST00000542443 MTORP42345 2549 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 IGKV4-1P06312 121 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 HTN1P15515 57 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 COX7BP24311 80 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 REG3AQ06141 175 aa3.08□□□□□ -1.92
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TRDN-204ENST00000542443 Q1T7F1 81 aa3.08□□□□□ -1.92
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TRDN-204ENST00000542443 DYNLRB2Q8TF09 96 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 CCL19Q99731 98 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 AKAP6Q13023 2319 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 hDV103S1A0JD37 113 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 BPY2O14599 106 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 APCP25054 2843 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 CSPG4Q6UVK1 2322 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 KLK12Q9UKR0 248 aa3.06□□□□□ -1.92
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