RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-222	ENST00000540445	HIST1H2BC	P62807	126 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445		Q8NBF4	154 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		5.18	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.17	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445		A0A0U1RQV1	116 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	IGLV6-57	P01721	117 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445		Q6ZRX8	168 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445		Q9BRP9	147 aa		5.16	□□□□□ -1.58
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	SPINK1	P00995	79 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	MOBP	Q13875	183 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	LINC00483	Q53H64	154 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	LINC01545	Q5VT33	79 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.15	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF815P	A8K554	130 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	KRTDAP	P60985	99 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		5.14	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	C3orf79	P0CE67	100 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	SPANXC	Q9NY87	97 aa		5.13	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	TIMM17B	O60830	172 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	LITAF	Q99732	161 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		5.12	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		5.11	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		5.11	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		5.11	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	C20orf202	A1L168	122 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	C5orf52	A6NGY3	159 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	SLC25A20	O43772	301 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	ATOH7	Q8N100	152 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LMO3-222	ENST00000540445	GHRH	P01286	108 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	COX7B	P24311	80 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	TAL2	Q16559	108 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445		Q8N377	158 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	COPS9	Q8WXC6	57 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445		A6NDN8	102 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	AKR1D1	P51857	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	IFITM1	P13164	125 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	PCP2	Q8IVA1	136 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	SPRR1B	P22528	89 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445		Q1RN00	199 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445		Q6ZVH6	145 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445		A0A1B0GWB2	263 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	S100A6	P06703	90 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	S100A2	P29034	98 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LMO3-222	ENST00000540445	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	LIMD2	Q9BT23	127 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	PRO1933	Q9H354	126 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445		A4D1N5	150 aa		5	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445		H7C2G1	150 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	VAMP3	Q15836	100 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	C12orf57	Q99622	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	CD164	Q04900	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LMO3-222	ENST00000540445	XP32	Q5T750	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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