RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-214ENST00000530727 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-214ENST00000530727 M0R378 163 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-214ENST00000530727 LECT2O14960 151 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-214ENST00000530727 COX8AP10176 69 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-214ENST00000530727 UBE2D1P51668 147 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRC-214ENST00000530727 LINC01554Q52M75 96 aa2.6□□□□□ -1.99
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PTPRC-214ENST00000530727 H3BRM9 83 aa2.55□□□□□ -2
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PTPRC-214ENST00000530727 K7ERJ3 54 aa2.55□□□□□ -2
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PTPRC-214ENST00000530727 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 H3BQ85 93 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 M0R143 59 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFA1O15239 70 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 SS18Q15532 418 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 CLPSL2Q6UWE3 100 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-214ENST00000530727 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRC-214ENST00000530727 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-214ENST00000530727 TIMM17BO60830 172 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRC-214ENST00000530727 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.53□□□□□ -2
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