RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530483.1

TTC17-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 2

Gene TTC17, Length 456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-211ENST00000530483 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.07□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.07□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 Q6ZN92 141 aa2.07□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa2.07□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.07□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 AMELXQ99217 191 aa2.07□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 LITAFQ99732 161 aa2.07□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 GNB1LQ9BYB4 327 aa2.07□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 FAT1Q14517 4588 aa2.07□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 A0A1B0GWB2 263 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 A6NDN8 102 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 J3QQQ9 107 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 TAX1BP3O14907 124 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 SEC11AP67812 179 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 LCE3AQ5TA76 89 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 REG3GQ6UW15 175 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 TOMM6Q96B49 74 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 LINC01600Q96MT4 127 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 PMCHL2Q9BQD1 86 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.06□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 LINC01546A6NGU7 62 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 LINC01549A6NIU2 74 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 K7EP34 96 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 IFITM1P13164 125 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 PFN2P35080 140 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 KRTAP10-8P60410 259 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 HERVK_113P63121 156 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 SPATA45Q537H7 98 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 C1orf137Q5JT78 98 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 Q5XG85 94 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 C2orf82Q6UX34 121 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 LINC00173Q6ZV60 143 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 Q8IZM0 81 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 TIMM17AQ99595 171 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 TOMM7Q9P0U1 55 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa2.05□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 FAM168BA1KXE4 195 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 H3BRM9 83 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 SERF1AO75920 110 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 IGLV7-43P04211 117 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 UBE2BP63146 152 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 Q6Q795 121 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa2.04□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 NDUFAF8A1L188 74 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 C8orf87E5RJ46 101 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 F8VRH5 84 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 NUPR1O60356 82 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 C3orf79P0CE67 100 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 CXCL5P42830 114 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 TMEM258P61165 79 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 Q6ZVQ6 151 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 C18orf32Q8TCD1 76 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 COX7B2Q8TF08 81 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 DIRC1Q969H9 104 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 C22orf24Q9Y442 160 aa2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.03□□□□□ -2.08
TTC17-211ENST00000530483 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 F8W1H4 67 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 H0Y9J4 135 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 MT-ATP8P03928 68 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 NMUP48645 174 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 KRTDAPP60985 99 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 BAGE3Q86Y29 109 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 BRK1Q8WUW1 75 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.02□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 HERC1Q15751 4861 aa2.01□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.01□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 A0A096LNJ9 63 aa2.01□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 UQCRQO14949 82 aa2.01□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 NDUFS5O43920 106 aa2.01□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 ZNF861PO60384 105 aa2.01□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 HBDP02042 147 aa2.01□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 COX8AP10176 69 aa2.01□□□□□ -2.09
TTC17-211ENST00000530483 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms