RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529045.1

PTPN22-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 4

Gene PTPN22, Length 527 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-208	ENST00000529045	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045		Q6ZTI0	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	ESM1	Q9NQ30	184 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	PRM2	P04554	102 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	RYR1	P21817	5038 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-208	ENST00000529045	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	CCL24	O00175	119 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045		Q6ZVQ6	151 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	KIAA0087	Q14695	138 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	HERC2	O95714	4834 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	MIF	P14174	115 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045		A0A1B0GW54	56 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045		F8WEM9	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	HAMP	P81172	84 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045		A0A0J9YWU9	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	NREP	Q16612	68 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPN22-208	ENST00000529045	SORL1	Q92673	2214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	COX7B	P24311	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	RMI2	Q96E14	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	BPY2	O14599	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045		A0A0U1RQV1	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045		Q6ZQY7	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	LYST	Q99698	3801 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	LCE6A	A0A183	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	ESRG	Q1W209	222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	REG3A	Q06141	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPN22-208	ENST00000529045		M0R2N4	97 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045		M0R378	163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045		Q8NDZ9	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045		V9GYY9	64 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045		Q1T7F1	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045		Q6ZTC4	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN22-208	ENST00000529045	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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