RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 CBX5P45973 191 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 HBBP68871 147 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 FABP5Q01469 135 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 COMMD7Q86VX2 200 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 GPX8Q8TED1 209 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 LXNQ9BS40 222 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANP32EQ9BTT0 268 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 MROQ9BYG7 248 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 PARVBQ9HBI1 364 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 LYRM4Q9HD34 91 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 SDHAF2Q9NX18 166 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 CHMP5Q9NZZ3 219 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 PSME2Q9UL46 239 aa-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 MCRIP1C9JLW8 97 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 H0Y9P7 68 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 M0QYV0 167 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CIB2O75838 187 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 FABP1P07148 127 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 OCM2P0CE71 109 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SERPINB1P30740 379 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 HIST1H3AP68431 136 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDK6Q00534 326 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 HIST2H3AQ71DI3 136 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TCTE3Q8IZS6 198 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM9CQ8IZT9 166 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 FIS1Q9Y3D6 152 aa-1.29□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRBV19A0A075B6N1 114 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TSTD3H0UI37 97 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR1I1O60431 355 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CYB5AP00167 134 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 GCGP01275 180 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 UBBP0CG47 229 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SMIM17P0DL12 118 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGLC2P0DOY2 106 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 UBE2G1P62253 170 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 HERVK_113P63121 156 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 FADDQ13158 208 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 RHEBQ15382 184 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 MEIG1Q5JSS6 88 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM91Q6ZNR0 172 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 OTUD6BQ8N6M0 293 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CENPKQ9BS16 269 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 C6orf50Q9HD87 102 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 PSENENQ9NZ42 101 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SAR1BQ9Y6B6 198 aa-1.3□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 A0A1B0GU69 56 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM218A2RU14 115 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 B4DEV8 164 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 C9JAW5 83 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 H0YCG3 227 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 K7EMI3 77 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 UQCRQO14949 82 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 IL5P05113 134 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SULT1E1P49888 294 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TAS2R30P59541 319 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 VBP1P61758 197 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SMCO1Q147U7 214 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TEX261Q6UWH6 196 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCDC148Q8NFR7 591 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CIB1Q99828 191 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 RERGLQ9H628 205 aa-1.31□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 K7EN84 100 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TAX1BP3O14907 124 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CHP2O43745 196 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 PYYP10082 97 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 AIF1P55008 147 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 DSTNP60981 165 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 NAA20P61599 178 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 PSPHP78330 225 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CAV1Q03135 178 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 STX3Q13277 289 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 HMGN3Q15651 99 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CCDC153Q494R4 210 aa-1.32□□□□□ -2.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms