RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520837.5

TSPAN18-208, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-208ENST00000520837 FAT1Q14517 4588 aa5.99□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.99□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 MTURNQ8N3F0 131 aa5.99□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 SIGMAR1Q99720 223 aa5.99□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.98□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.98□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 NDUFC2O95298 119 aa5.98□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 TSPAN13O95857 204 aa5.98□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.98□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.98□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 Q6ZRP5 223 aa5.98□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.98□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 NCR3O14931 201 aa5.97□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.97□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
TSPAN18-208ENST00000520837 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 COX6CP09669 75 aa5.96□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 DPH3Q96FX2 82 aa5.96□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.95□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.95□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 H3BMG7 143 aa5.95□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 M0QXV9 152 aa5.95□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 M0R378 163 aa5.95□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV2D-28P01615 120 aa5.95□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 XGP55808 180 aa5.95□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC00337Q8N6G1 96 aa5.95□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.95□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.95□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.94□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 Q8N1X5 172 aa5.94□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.94□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM126AQ9H061 195 aa5.94□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A1B0GV72 72 aa5.93□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.93□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 HERC1Q15751 4861 aa5.93□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A096LNI7 61 aa5.92□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 EPM2AB3EWF7 344 aa5.92□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 Q8NDZ9 215 aa5.92□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.92□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 PRO0461Q9UI25 63 aa5.92□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.91□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.9□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM168BA1KXE4 195 aa5.9□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLV6-57P01721 117 aa5.9□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 ETDBQ3ZM63 59 aa5.9□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 Q5VSD8 79 aa5.9□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.9□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC01600Q96MT4 127 aa5.9□□□□□ -1.46
TSPAN18-208ENST00000520837 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.89□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 H0YGX0 51 aa5.89□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 SNCGO76070 127 aa5.89□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 CHTF8P0CG12 524 aa5.89□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 ATXN8Q156A1 80 aa5.89□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 Q6ZVQ6 151 aa5.89□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 SCXQ7RTU7 201 aa5.89□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 C7orf33Q8WU49 177 aa5.89□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 C22orf24Q9Y442 160 aa5.89□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.88□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 Q6ZSA8 131 aa5.88□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 TEN1Q86WV5 123 aa5.88□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.87□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 TCL1BO95988 128 aa5.87□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 C6orf99Q4VX62 202 aa5.87□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 CLEC2BQ92478 149 aa5.87□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 DIRC1Q969H9 104 aa5.87□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A1W2PNN7 141 aa5.86□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 UBE2BP63146 152 aa5.86□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.86□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC00167Q96N53 147 aa5.86□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 SLC25A20O43772 301 aa5.85□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 DNAL4O96015 105 aa5.85□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.85□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 COX7BP24311 80 aa5.85□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.84□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 PANO1I0J062 215 aa5.84□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 LST1O00453 97 aa5.84□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.84□□□□□ -1.47
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.83□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.83□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 C9JAW5 83 aa5.83□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.83□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 MYCBP2O75592 4640 aa5.83□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A087WYN8 130 aa5.82□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 TRACP01848 142 aa5.82□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 REG3GQ6UW15 175 aa5.82□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.82□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.82□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.81□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.81□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A1B0GX51 115 aa5.8□□□□□ -1.48
TSPAN18-208ENST00000520837 hADV29S1A0JD25 119 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms