RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 SPRR4Q96PI1 79 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 ERC2-IT1O76042 136 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 Q9BRP9 147 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 LRP2P98164 4655 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 S100A12P80511 92 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 SCGB1D1O95968 90 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 Q6ZRX8 168 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 IFITM1P13164 125 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 Q6ZVH6 145 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00483Q53H64 154 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
SH3BP2-225ENST00000513069 TSPAN13O95857 204 aa8.83□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 COPS9Q8WXC6 57 aa8.83□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.82□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 LPAP08519 4548 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 COX8AP10176 69 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 C6orf99Q4VX62 202 aa8.8□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.8□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.8□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 A6NDN8 102 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 DLEU1O43261 78 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
SH3BP2-225ENST00000513069 COX7BP24311 80 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 C14orf144Q96I85 54 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 A4D1N5 150 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 SPATA45Q537H7 98 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 PRR4Q16378 134 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 Q8NBF4 154 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 SPRR1BP22528 89 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 CTAG1AP78358 180 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 PYY3Q5JQD4 70 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 VAMP8Q9BV40 100 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 MOBPQ13875 183 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 HIST1H4GQ99525 98 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A1B0GWB2 263 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 HIGD1BQ9P298 99 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 RNF213Q63HN8 5207 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 C12orf57Q99622 126 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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SH3BP2-225ENST00000513069 CFC1P0CG37 223 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 SPINK1P00995 79 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 SMIM29Q86T20 159 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP2-225ENST00000513069 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 TAL2Q16559 108 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC00575Q6W349 94 aa8.63□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 VAMP3Q15836 100 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 Q1RN00 199 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 CEND1Q8N111 149 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 Q8N377 158 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A0B4J2C4 111 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SH3BP2-225ENST00000513069 FXYD2P54710 66 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 hADV29S1A0JD25 119 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 H7C2G1 150 aa8.57□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC25A20O43772 301 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 TPRXLQ17RH7 258 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 RAB37Q96AX2 223 aa8.56□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 Q6ZQY7 126 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A0G2JQZ4 141 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 HSD52Q0P140 79 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 PRO1933Q9H354 126 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.52□□□□□ -1.05
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