RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 DDTP30046 118 aa6.74□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.73□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 SNAPINO95295 136 aa6.73□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 APOC3P02656 99 aa6.73□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 Q8N377 158 aa6.73□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.72□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 HSBP1O75506 76 aa6.72□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 ERC2-IT1O76042 136 aa6.72□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFA5Q16718 116 aa6.72□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.72□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.72□□□□□ -1.33
CNOT4-211ENST00000498534 H0Y8G0 127 aa6.71□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.71□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZRX8 168 aa6.71□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 SVBPQ8N300 66 aa6.71□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 LEPROTO15243 131 aa6.7□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 Q9BRP9 147 aa6.7□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.7□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFC2O95298 119 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 PLNP26678 52 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 HERVK_113P61574 105 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 J3QQQ9 107 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 LEPROTL1O95214 131 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV6-57P01721 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 NMUP48645 174 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 C5orf52A6NGY3 159 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 DPM2O94777 84 aa6.65□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 YPEL4Q96NS1 127 aa6.65□□□□□ -1.34
CNOT4-211ENST00000498534 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.64□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.63□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.63□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 IGKCP01834 107 aa6.62□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 FABP4P15090 132 aa6.62□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 NPC2P61916 151 aa6.62□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 LIMD2Q9BT23 127 aa6.62□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 SERF1AO75920 110 aa6.61□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.61□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 TRGC2P03986 189 aa6.6□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.6□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.6□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0J9YXY3 114 aa6.59□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 C9orf118A6NHY6 69 aa6.59□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.59□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.59□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.59□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.59□□□□□ -1.35
CNOT4-211ENST00000498534 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.58□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 SPRR1BP22528 89 aa6.58□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 PCOTHQ58A44 107 aa6.58□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.58□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.57□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 E9PLD3 99 aa6.57□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 SPANXCQ9NY87 97 aa6.57□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 C9orf92A6NGG3 77 aa6.56□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 TAL2Q16559 108 aa6.56□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 CFC1BP0CG36 223 aa6.55□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.55□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 CD164Q04900 197 aa6.54□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.54□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.54□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 PRO1933Q9H354 126 aa6.54□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 TIMM17BO60830 172 aa6.53□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 COX7BP24311 80 aa6.53□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.53□□□□□ -1.36
CNOT4-211ENST00000498534 H7C2G1 150 aa6.52□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 MT1HP80294 61 aa6.52□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.51□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 AKR1D1P51857 326 aa6.51□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 Q1RN00 199 aa6.51□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.51□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 C6orf99Q4VX62 202 aa6.51□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 LITAFQ99732 161 aa6.51□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.5□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF815PA8K554 130 aa6.49□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.49□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.48□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 Q5XG85 94 aa6.48□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 M0R2T5 61 aa6.47□□□□□ -1.37
CNOT4-211ENST00000498534 COLCA2A8K830 154 aa6.46□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 C1orf195Q5TG92 126 aa6.46□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 COPS9Q8WXC6 57 aa6.46□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1B0GWB2 263 aa6.45□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 LINC01545Q5VT33 79 aa6.45□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 PET117Q6UWS5 81 aa6.45□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.45□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 A6NDN8 102 aa6.44□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.44□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 SMIM29Q86T20 159 aa6.44□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 A4D1N5 150 aa6.43□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 TCL1BO95988 128 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.9 ms