RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497977.1

PTPRN-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-218ENST00000497977 PRYO14603 147 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRN-218ENST00000497977 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRN-218ENST00000497977 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 IFITM1P13164 125 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 DDTP30046 118 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 Q6ZVH6 145 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 HIGD1BQ9P298 99 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 A4D1N5 150 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 A6NDN8 102 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 TSTD3H0UI37 97 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 HSD52Q0P140 79 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 CTAG1AP78358 180 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 PRLHP81277 87 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 CEND1Q8N111 149 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 FXYD2P54710 66 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRN-218ENST00000497977 H7C2G1 150 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 IGLV6-57P01721 117 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 SPRR1AP35321 89 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 TAL2Q16559 108 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 RAB37Q96AX2 223 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 A6NJY4 79 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 K7ERJ3 54 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 Q1RN00 199 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 C6orf99Q4VX62 202 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 B5MCH6 92 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 BATFQ16520 125 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 A0A0B4J2C4 111 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 CFC1BP0CG36 223 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 CFC1P0CG37 223 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 VAMP3Q15836 100 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 Q6ZRX8 168 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 SPRR4Q96PI1 79 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 M0R143 59 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRN-218ENST00000497977 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 COX7BP24311 80 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 A0A087X002 238 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 SNCGO76070 127 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 TSPAN13O95857 204 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 PRR4Q16378 134 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 Q9BRP9 147 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 A0A1B0GWB2 263 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 SLC25A20O43772 301 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 ERC2-IT1O76042 136 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 SPINK1P00995 79 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 PSMB2P49721 201 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00483Q53H64 154 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRN-218ENST00000497977 TRIAP1O43715 76 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 TNXBP22105 4242 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 CLEC2BQ92478 149 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 GHRHP01286 108 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 LINC00575Q6W349 94 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 Q8NBF4 154 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRN-218ENST00000497977 hADV29S1A0JD25 119 aa6.03□□□□□ -1.44
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