RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.15□□□□□ -1.42
CTPS1-211ENST00000497210 A0A087WYN8 130 aa6.14□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 FAM168BA1KXE4 195 aa6.14□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 FXYD2P54710 66 aa6.14□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.14□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2BP63146 152 aa6.13□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 BATFQ16520 125 aa6.13□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.13□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.13□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 C7orf33Q8WU49 177 aa6.13□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM126AQ9H061 195 aa6.13□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 C22orf24Q9Y442 160 aa6.13□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 PANO1I0J062 215 aa6.12□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 Q1RN00 199 aa6.12□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 SCXQ7RTU7 201 aa6.12□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.11□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PNN7 141 aa6.11□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV2D-28P01615 120 aa6.11□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.11□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.11□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.1□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GWB2 263 aa6.1□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 EPM2AB3EWF7 344 aa6.1□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.1□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 Q8NDZ9 215 aa6.1□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.1□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.09□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV6-57P01721 117 aa6.09□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 CFC1BP0CG36 223 aa6.09□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 CFC1P0CG37 223 aa6.09□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CTPS1-211ENST00000497210 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.08□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.08□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 K7ERJ3 54 aa6.08□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 CDK2AP2O75956 126 aa6.08□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.08□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 DIRC1Q969H9 104 aa6.08□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 LINC00167Q96N53 147 aa6.08□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 IGKV2-30P06310 120 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 H7C2G1 150 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 COX6CP09669 75 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 VAMP3Q15836 100 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 REG3GQ6UW15 175 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 PSMB2P49721 201 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 BCE1O60756 84 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 SNCGO76070 127 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 TSPAN13O95857 204 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 HAMPP81172 84 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 C6orf99Q4VX62 202 aa6.03□□□□□ -1.44
CTPS1-211ENST00000497210 SPRR1AP35321 89 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 UBE2AP49459 152 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 XGP55808 180 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 C1orf137Q5JT78 98 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.02□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 SLC25A20O43772 301 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 COX7BP24311 80 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 Q6ZRX8 168 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 H0Y9J4 135 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 H0YGX0 51 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 TAX1BP3O14907 124 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 H3BUT2 72 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 FABP2P12104 132 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1B0GX51 115 aa5.97□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 DNAL4O96015 105 aa5.97□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 IGLV7-43P04211 117 aa5.97□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 PRLHP81277 87 aa5.97□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.97□□□□□ -1.45
CTPS1-211ENST00000497210 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.96□□□□□ -1.46
CTPS1-211ENST00000497210 A0A1W2PPM0 123 aa5.96□□□□□ -1.46
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF861PO60384 105 aa5.96□□□□□ -1.46
CTPS1-211ENST00000497210 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CTPS1-211ENST00000497210 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.96□□□□□ -1.46
CTPS1-211ENST00000497210 ATXN8Q156A1 80 aa5.96□□□□□ -1.46
CTPS1-211ENST00000497210 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.96□□□□□ -1.46
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
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