RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492338.2

TNS1-218, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-218ENST00000492338 TSPAN13O95857 204 aa6.12□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 PRR4Q16378 134 aa6.12□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.12□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.11□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 DAND5Q8N907 189 aa6.11□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 LRP2P98164 4655 aa6.11□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 E9PLD3 99 aa6.1□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 Q6ZVQ6 151 aa6.1□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.1□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.09□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.09□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.09□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.09□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.09□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.09□□□□□ -1.43
TNS1-218ENST00000492338 DDTP30046 118 aa6.08□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 A0A0J9YXY3 114 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 C20orf202A1L168 122 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 NDUFC2O95298 119 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 KRTDAPP60985 99 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 LINC01545Q5VT33 79 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 SPRR1AP35321 89 aa6.06□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 SPRR4Q96PI1 79 aa6.06□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.06□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 C3orf79P0CE67 100 aa6.05□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 NPC2P61916 151 aa6.05□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.05□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.05□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.04□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 ZNF815PA8K554 130 aa6.04□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 TIMM17BO60830 172 aa6.04□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 AKR1D1P51857 326 aa6.03□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 CTAG1AP78358 180 aa6.03□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.03□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.03□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.03□□□□□ -1.44
TNS1-218ENST00000492338 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.02□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 IGLV6-57P01721 117 aa6.02□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.02□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.02□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.02□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.02□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.01□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 Q6ZRX8 168 aa6.01□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 SPANXCQ9NY87 97 aa6.01□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 S100A1P23297 94 aa6□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 SEC61GP60059 68 aa6□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 COPS9Q8WXC6 57 aa6□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 S100A2P29034 98 aa5.99□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 LITAFQ99732 161 aa5.99□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.99□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 ERC2-IT1O76042 136 aa5.98□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 LINC00483Q53H64 154 aa5.98□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 ATOH7Q8N100 152 aa5.98□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 Q8NBF4 154 aa5.98□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.98□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.98□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 Q9BRP9 147 aa5.97□□□□□ -1.45
TNS1-218ENST00000492338 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.96□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 S100A6P06703 90 aa5.96□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 IFITM1P13164 125 aa5.96□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 Q6ZVH6 145 aa5.96□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.96□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.95□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 SPINK1P00995 79 aa5.95□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 MOBPQ13875 183 aa5.95□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.95□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.94□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 LPAP08519 4548 aa5.93□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 A6NDN8 102 aa5.93□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 COX7BP24311 80 aa5.93□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.93□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 PCP2Q8IVA1 136 aa5.93□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.93□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 C6orf99Q4VX62 202 aa5.92□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.92□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.92□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.92□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.91□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 TAL2Q16559 108 aa5.91□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 PRAC1Q96KF2 57 aa5.91□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.9□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.9□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 TPRXLQ17RH7 258 aa5.9□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.9□□□□□ -1.46
TNS1-218ENST00000492338 SLC25A20O43772 301 aa5.89□□□□□ -1.47
TNS1-218ENST00000492338 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
TNS1-218ENST00000492338 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.89□□□□□ -1.47
TNS1-218ENST00000492338 A0A1B0GWB2 263 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.5 ms