RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491005.5

RAB3GAP2-209, Transcript of RAB3 GTPase activating non-catalytic protein subunit 2, human

TSL 2

Gene RAB3GAP2, Length 897 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	MRAP	Q8TCY5	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	NF1	P21359	2839 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	AKAP9	Q99996	3911 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		F8WEM9	126 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	KRTAP10-2	P60368	255 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		A0A087WVE0	104 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	BPY2	O14599	106 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C14orf177	Q52M58	125 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C3orf56	Q8N813	242 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C5orf47	Q569G3	176 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		Q6ZRU5	148 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	NOTCH2	Q04721	2471 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	ACAN	P16112	2415 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		Q6ZTC4	211 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C20orf197	Q8N268	126 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C15orf56	Q8N910	161 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	DPH3	Q96FX2	82 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	SMR3A	Q99954	134 aa		5	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	ESRG	Q1W209	222 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	PDZD2	O15018	2839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		Q6ZRX8	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	NDUFB1	O75438	58 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		Q6ZRP5	223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		Q8NDZ9	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	SPRR1A	P35321	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		Q8NBF4	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		H7BZZ5	65 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	UBE2B	P63146	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	PSCA	O43653	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		Q8N377	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		H3BPC8	53 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	RETN	Q9HD89	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		H0Y9J4	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	MP68	P56378	58 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	ATR	Q13535	2644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		V9GYY9	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		A0A0U1RQV1	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005		M0R2N4	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	UBE2A	P49459	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RAB3GAP2-209	ENST00000491005	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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