RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490140.1

FDPS-215, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene FDPS, Length 680 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-215ENST00000490140 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
FDPS-215ENST00000490140 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
FDPS-215ENST00000490140 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
FDPS-215ENST00000490140 Q8N377 158 aa6.6□□□□□ -1.35
FDPS-215ENST00000490140 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.6□□□□□ -1.35
FDPS-215ENST00000490140 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.59□□□□□ -1.35
FDPS-215ENST00000490140 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.59□□□□□ -1.35
FDPS-215ENST00000490140 B5MCH6 92 aa6.58□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 DDTP30046 118 aa6.58□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 XP32Q5T750 250 aa6.58□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 Q6ZRX8 168 aa6.58□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.58□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.57□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 A0A1B0GV90 55 aa6.56□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.56□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.56□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 LIMD2Q9BT23 127 aa6.55□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.54□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 HSBP1O75506 76 aa6.54□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.54□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.54□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 SERF1AO75920 110 aa6.53□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 NDUFC2O95298 119 aa6.53□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 CFC1BP0CG36 223 aa6.53□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 FABP4P15090 132 aa6.53□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 NMUP48645 174 aa6.53□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 HERVK_113P61574 105 aa6.53□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 Q9BRP9 147 aa6.53□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.53□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.53□□□□□ -1.36
FDPS-215ENST00000490140 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.52□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 TSTD3H0UI37 97 aa6.52□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 ERC2-IT1O76042 136 aa6.52□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 PLNP26678 52 aa6.52□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 C14orf144Q96I85 54 aa6.52□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.52□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 LEPROTO15243 131 aa6.51□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 IGLV6-57P01721 117 aa6.51□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.51□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 H0Y8G0 127 aa6.5□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 J3QQQ9 107 aa6.49□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.49□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 LEPROTL1O95214 131 aa6.47□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.47□□□□□ -1.37
FDPS-215ENST00000490140 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.46□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 C20orf202A1L168 122 aa6.46□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 DLEU1O43261 78 aa6.46□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 DPM2O94777 84 aa6.46□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 SCGB1D1O95968 90 aa6.46□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 LINC00310P59036 64 aa6.46□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.46□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.46□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 KRTDAPP60985 99 aa6.44□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 PCOTHQ58A44 107 aa6.44□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 IGKCP01834 107 aa6.43□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 SPRR1BP22528 89 aa6.43□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 LCE2CQ5TA81 110 aa6.43□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.43□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 C9orf92A6NGG3 77 aa6.42□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 MT1HP80294 61 aa6.42□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 CD164Q04900 197 aa6.42□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 PYY3Q5JQD4 70 aa6.42□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 SPANXCQ9NY87 97 aa6.42□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 NPC2P61916 151 aa6.41□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 PET117Q6UWS5 81 aa6.41□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.41□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.41□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 A0A0J9YXY3 114 aa6.4□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 C3orf79P0CE67 100 aa6.4□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.4□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 PRO1933Q9H354 126 aa6.4□□□□□ -1.38
FDPS-215ENST00000490140 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.39□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 H7C2G1 150 aa6.39□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 M0R143 59 aa6.39□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 M0R2T5 61 aa6.39□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.39□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 A4D1N5 150 aa6.38□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 TAL2Q16559 108 aa6.38□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.38□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.38□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 E9PLD3 99 aa6.37□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 COX7BP24311 80 aa6.37□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 Q5XG85 94 aa6.37□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 VAMP8Q9BV40 100 aa6.37□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.36□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 TIMM17BO60830 172 aa6.36□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.36□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.36□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.36□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 Q1RN00 199 aa6.35□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 LINC01545Q5VT33 79 aa6.35□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 COPS9Q8WXC6 57 aa6.35□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.34□□□□□ -1.39
FDPS-215ENST00000490140 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms