RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 RPL28P46779 137 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa13.13□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 CEND1Q8N111 149 aa13.12□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa13.11□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 DIRC1Q969H9 104 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.1□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 H0Y9J4 135 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 HSD52Q0P140 79 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXD10-202ENST00000490088 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 FXYD2P54710 66 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 B5MCH6 92 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 CFC1BP0CG36 223 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 CFC1P0CG37 223 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 HIGD2AQ9BW72 106 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 PCLOQ9Y6V0 5065 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 A6NJY4 79 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 C6orf99Q4VX62 202 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 SMIM11BQ8TCY0 68 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 MYCBP2O75592 4640 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXD10-202ENST00000490088 TSTD3H0UI37 97 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 Q6ZRX8 168 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 A0A0B4J2C4 111 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 RAB37Q96AX2 223 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 SMCR5Q8TEV8 140 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 Q9BRP9 147 aa12.99□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 H7C2G1 150 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 COX7BP24311 80 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 CTAG1AP78358 180 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 FAT3Q8TDW7 4589 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 OXTP01178 125 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 ERC2-IT1O76042 136 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 K7ERJ3 54 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 LINC01600Q96MT4 127 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 PRO1854Q9UHT4 67 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 A0A1B0GWB2 263 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 ANAPC11Q9NYG5 84 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 Q1RN00 199 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXD10-202ENST00000490088 SPRR4Q96PI1 79 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD10-202ENST00000490088 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXD10-202ENST00000490088 M0R143 59 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD10-202ENST00000490088 VAMP3Q15836 100 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD10-202ENST00000490088 PRR26Q8N8Z3 221 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXD10-202ENST00000490088 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
HOXD10-202ENST00000490088 J3QL48 77 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXD10-202ENST00000490088 MT1HL1P0DM35 61 aa12.86□□□□□ -0.35
HOXD10-202ENST00000490088 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXD10-202ENST00000490088 A0A087X002 238 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 GAGE2AQ6NT46 116 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP10-8P60410 259 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 LINC00575Q6W349 94 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 TSPAN13O95857 204 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 FAM229BQ4G0N7 80 aa12.81□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 CRYGAP11844 174 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 TRIAP1O43715 76 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 SLC25A20O43772 301 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 BATFQ16520 125 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 LINC00483Q53H64 154 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD10-202ENST00000490088 PSMB2P49721 201 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 hADV29S1A0JD25 119 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 H0YGX0 51 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 TNXBP22105 4242 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 DEFB105AQ8NG35 78 aa12.75□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 TYMSOSQ8TAI1 123 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 FAM218AQ96MZ4 157 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 Q6ZQY7 126 aa12.71□□□□□ -0.37
HOXD10-202ENST00000490088 SPRR1BP22528 89 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 COX6CP09669 75 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 CLEC2BQ92478 149 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 PCP4L1A6NKN8 68 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 SNCGO76070 127 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 Q8N377 158 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 SCGB1C2P0DMR2 95 aa12.65□□□□□ -0.38
HOXD10-202ENST00000490088 MOBPQ13875 183 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXD10-202ENST00000490088 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXD10-202ENST00000490088 A0A1B0GX51 115 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXD10-202ENST00000490088 SNHG12Q9BXW3 62 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXD10-202ENST00000490088 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms