RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487202.5

WDR3-204, Transcript of WD repeat domain 3, human

TSL 3

Gene WDR3, Length 680 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
WDR3-204	ENST00000487202	VPREB1	P12018	145 aa		5	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	PFN2	P35080	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202		H3BRM9	83 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	SPINK1	P00995	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
WDR3-204	ENST00000487202	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	COX17	Q14061	63 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	PMVK	Q15126	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	DAND5	Q8N907	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202		Q8NBF4	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202		Q8NDZ9	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	BATF	Q16520	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	SERF1A	O75920	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202		K7ERU9	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	KRTDAP	P60985	99 aa		4.92	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202		Q8N377	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WDR3-204	ENST00000487202	SLC25A20	O43772	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	SPRR1A	P35321	89 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.9	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	HSBP1	O75506	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	LINC00158	P58513	81 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	MT1H	P80294	61 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	VAMP3	Q15836	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	MOBP	Q13875	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202		A0A0U1RRA0	63 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202		A0A096LNJ9	63 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202		A6NDN8	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	NCR3	O14931	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
WDR3-204	ENST00000487202	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	HBD	P02042	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202		J3QR89	54 aa		4.82	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.82	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.82	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.82	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.81	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	HERV-K104	P63124	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202		Q6ZRX8	168 aa		4.81	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.81	□□□□□ -1.64
WDR3-204	ENST00000487202		Q9BRP9	147 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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