RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.09□□□□□ -1.27
ARHGEF3-211ENST00000486829 REG3GQ6UW15 175 aa7.08□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.08□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.08□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 A6NDN8 102 aa7.07□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 C1orf137Q5JT78 98 aa7.07□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.07□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 BCE1O60756 84 aa7.06□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A0B4J2C4 111 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 M0R143 59 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPRR1AP35321 89 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 FXYD2P54710 66 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB37Q96AX2 223 aa7.05□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 H3BS24 57 aa7.04□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGLV7-43P04211 117 aa7.04□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 CFC1BP0CG36 223 aa7.03□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 CFC1P0CG37 223 aa7.03□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 CTAG1AP78358 180 aa7.03□□□□□ -1.28
ARHGEF3-211ENST00000486829 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.02□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 H0Y9J4 135 aa7.02□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBE2AP49459 152 aa7.02□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.02□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 DIRC1Q969H9 104 aa7.02□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.01□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1B0GWB2 263 aa7.01□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF861PO60384 105 aa7.01□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.01□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.01□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPINK6Q6UWN8 80 aa7□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 C6orf99Q4VX62 202 aa6.99□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6ZRX8 168 aa6.99□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.99□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.99□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 B5MCH6 92 aa6.98□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRLHP81277 87 aa6.98□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 VAMP3Q15836 100 aa6.98□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q1RN00 199 aa6.97□□□□□ -1.29
ARHGEF3-211ENST00000486829 H7C2G1 150 aa6.96□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 K7ERJ3 54 aa6.96□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 COX7BP24311 80 aa6.96□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.96□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.95□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 MYCBP2O75592 4640 aa6.94□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 H0YGX0 51 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC25A20O43772 301 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 TSPAN13O95857 204 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 COX6CP09669 75 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 BATFQ16520 125 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q9BRP9 147 aa6.92□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 SNCGO76070 127 aa6.91□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 PSMB2P49721 201 aa6.9□□□□□ -1.3
ARHGEF3-211ENST00000486829 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.89□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRIAP1O43715 76 aa6.89□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00575Q6W349 94 aa6.89□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A1B0GX51 115 aa6.88□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 HERC1Q15751 4861 aa6.87□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 hADV29S1A0JD25 119 aa6.87□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 ERC2-IT1O76042 136 aa6.87□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPRR4Q96PI1 79 aa6.87□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.87□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.86□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.86□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.86□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 OXTP01178 125 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00483Q53H64 154 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC01600Q96MT4 127 aa6.84□□□□□ -1.31
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 C9orf118A6NHY6 69 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 CRYGAP11844 174 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPRR1BP22528 89 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.83□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 TAX1BP3O14907 124 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 DNAL4O96015 105 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q6ZQY7 126 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.82□□□□□ -1.32
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLEC2BQ92478 149 aa6.82□□□□□ -1.32
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