RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 C3orf79P0CE67 100 aa2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHTF8P0CG12 524 aa2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 CKS2P33552 79 aa2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 PMVKQ15126 192 aa2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRELID3AQ96N28 172 aa2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.57□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 H3BMG7 143 aa2.56□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 COX8AP10176 69 aa2.56□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 KRTDAPP60985 99 aa2.56□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC00483Q53H64 154 aa2.56□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 BAGE3Q86Y29 109 aa2.56□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 ORMDL3Q8N138 153 aa2.56□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.56□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A096LNI7 61 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC01546A6NGU7 62 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGIPA6NJ69 53 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPP1R17O96001 155 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 FCER1GP30273 86 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 XCL1P47992 114 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 SEC61GP60059 68 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 COX6A2Q02221 97 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q8N8P6 123 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC01600Q96MT4 127 aa2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 IFITM1P13164 125 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 KIAA0087Q14695 138 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 C6orf226Q5I0X4 101 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q6ZRU5 148 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 C5orf38Q86SI9 138 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 AMELXQ99217 191 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIGD1BQ9P298 99 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRO0628Q9UI54 55 aa2.54□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 MYCBP2O75592 4640 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 C9JAW5 83 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 H3BUT2 72 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 MT-ATP8P03928 68 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 SMIM13P0DJ93 91 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 INAFM2P0DMQ5 153 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBE2D1P51668 147 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 KRTAP12-4P60329 112 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 SS18Q15532 418 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 TAL2Q16559 108 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPDPFLQ8WWR9 84 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 IMUPQ9GZP8 106 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-211ENST00000485621 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A0J9YXV3 536 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A1B0GWB2 263 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 COX7A2LO14548 114 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 SYCNQ0VAF6 134 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 LINC01545Q5VT33 79 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q5W150 140 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 ATOH7Q8N100 152 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 TOMM6Q96B49 74 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM141Q96I45 108 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 CARD19Q96LW7 228 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 V9GYY9 64 aa2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 A0A1W2PNN7 141 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC179H3BU77 68 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 K7EMI3 77 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 HSBP1O75506 76 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 APOMO95445 188 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 SPAG11BQ08648 103 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 C2orf82Q6UX34 121 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 TEN1Q86WV5 123 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 TIMM17AQ99595 171 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.51□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 UQCRQO14949 82 aa2.5□□□□□ -2.01
TRAPPC10-211ENST00000485621 SNCGO76070 127 aa2.5□□□□□ -2.01
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