RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485556.5

STRC-211, Transcript of stereocilin, humanhuman

TSL 5

Gene STRC, Length 4,253 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRC-211ENST00000485556 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.72□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 LRBAP50851 2863 aa6.71□□□□□ -1.33
STRC-211ENST00000485556 KIAA0087Q14695 138 aa6.71□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.71□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.71□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.7□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 ITPR2Q14571 2701 aa6.7□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.7□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.7□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 Q6ZRP5 223 aa6.7□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.7□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.7□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 PRR34Q9NV39 138 aa6.7□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 PRR4Q16378 134 aa6.69□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.69□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 CHTF8P0CG12 524 aa6.67□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.67□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.67□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 Q8N9L7 120 aa6.67□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 NDUFC1O43677 76 aa6.66□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 Q6ZRX8 168 aa6.65□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.65□□□□□ -1.34
STRC-211ENST00000485556 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.64□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 C16orf90A8MZG2 172 aa6.64□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 FAM168BA1KXE4 195 aa6.64□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 IGLV6-57P01721 117 aa6.64□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.64□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.64□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 C15orf56Q8N910 161 aa6.63□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.63□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 LINC00208Q96KT6 92 aa6.63□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.63□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 CASC2Q6XLA1 102 aa6.62□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.62□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 RTL8CO15255 209 aa6.61□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 ZANQ9Y493 2812 aa6.61□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 Q6ZQT0 140 aa6.61□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 CXCL6P80162 114 aa6.6□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 EPM2AB3EWF7 344 aa6.6□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 MOBPQ13875 183 aa6.59□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 Q8NBF4 154 aa6.59□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.59□□□□□ -1.35
STRC-211ENST00000485556 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.58□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.57□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 HCG22E2RYF7 251 aa6.57□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 FAM104AQ969W3 186 aa6.57□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 CASC10Q5T4H9 136 aa6.57□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.57□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.56□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.56□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.55□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.55□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 APCP25054 2843 aa6.54□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 HIVEP1P15822 2718 aa6.54□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 BCE1O60756 84 aa6.54□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 SMIM29Q86T20 159 aa6.54□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.53□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.53□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 PCOTHQ58A44 107 aa6.53□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 H0Y9P7 68 aa6.53□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.53□□□□□ -1.36
STRC-211ENST00000485556 A0A1B0GW54 56 aa6.52□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.51□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 APLNQ9ULZ1 77 aa6.5□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.5□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.5□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.5□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 A0A087WTM6 91 aa6.49□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.49□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 LIMD2Q9BT23 127 aa6.49□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 Q8N377 158 aa6.48□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.47□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 CRYGAP11844 174 aa6.47□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 A0A1W2PNN7 141 aa6.47□□□□□ -1.37
STRC-211ENST00000485556 MUC3AQ02505 3323 aa6.46□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.46□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.46□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 A0A0A0MQY5 61 aa6.46□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 hDV103S1A0JD37 113 aa6.46□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 A0A0G2JQZ4 141 aa6.45□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.45□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 DMDP11532 3685 aa6.45□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 NF1P21359 2839 aa6.45□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.44□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.44□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 ERC2-IT1O76042 136 aa6.44□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 IGFL1Q6UW32 110 aa6.44□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
STRC-211ENST00000485556 A6NED7 52 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms