RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483365.1

TAF1-216, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 1, human

TSL 2

Gene TAF1, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1-216	ENST00000483365	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TAF1-216	ENST00000483365	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TAF1-216	ENST00000483365	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TAF1-216	ENST00000483365	FXYD2	P54710	66 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TAF1-216	ENST00000483365	CTAG1A	P78358	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TAF1-216	ENST00000483365	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TAF1-216	ENST00000483365	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TAF1-216	ENST00000483365	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TAF1-216	ENST00000483365	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365		M0R378	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	DDT	P30046	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	TRIAP1	O43715	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	CFC1	P0CG37	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	UBE2B	P63146	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365		K7ERJ3	54 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365		A6NDN8	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365		A0A0B4J2C4	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365		M0R143	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	RYR1	P21817	5038 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	HSPG2	P98160	4391 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TAF1-216	ENST00000483365	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365		A0A1B0GWB2	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365		H7C2G1	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	PRY	O14603	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	BATF	Q16520	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	SPRR1A	P35321	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	PRLH	P81277	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365		Q5VSD8	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	BCE1	O60756	84 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	TSPAN13	O95857	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	FAT1	Q14517	4588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365		Q1RN00	199 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	ZNF861P	O60384	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	COX7B	P24311	80 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	UBE2A	P49459	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365		Q6ZRX8	168 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365		Q9BRP9	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TAF1-216	ENST00000483365	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365		H0Y9J4	135 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	PSMB2	P49721	201 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365		H3BUT2	72 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	VAMP3	Q15836	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	HERC2	O95714	4834 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TAF1-216	ENST00000483365	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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