RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483282.1

C1orf43-208, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf43, Length 456 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-208ENST00000483282 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.56□□□□□ -1.52
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C1orf43-208ENST00000483282 A0A096LPF7 62 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 SPRR1AP35321 89 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 Q8NAQ8 132 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 POLQO75417 2590 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 C2CD3Q4AC94 2353 aa5.55□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 ZFHX3Q15911 3703 aa5.54□□□□□ -1.52
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C1orf43-208ENST00000483282 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.54□□□□□ -1.52
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C1orf43-208ENST00000483282 C10orf25Q5T742 122 aa5.54□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 Q9BRP9 147 aa5.54□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
C1orf43-208ENST00000483282 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.52□□□□□ -1.53
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C1orf43-208ENST00000483282 C14orf177Q52M58 125 aa5.52□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 Q6ZRP5 223 aa5.52□□□□□ -1.53
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C1orf43-208ENST00000483282 HIVEP1P15822 2718 aa5.5□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.5□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 CD164Q04900 197 aa5.5□□□□□ -1.53
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C1orf43-208ENST00000483282 WFDC11Q8NEX6 87 aa5.5□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 B9D2Q9BPU9 175 aa5.5□□□□□ -1.53
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C1orf43-208ENST00000483282 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.5□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 ITPR3Q14573 2671 aa5.5□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 CCDC168Q8NDH2 2452 aa5.49□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.49□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.49□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.49□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.49□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 A0A087X002 238 aa5.48□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 SMIM29Q86T20 159 aa5.48□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 SMR3AQ99954 134 aa5.48□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.48□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.48□□□□□ -1.53
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C1orf43-208ENST00000483282 C3orf84H3BNL1 204 aa5.47□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 REG3GQ6UW15 175 aa5.47□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.47□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 Q8NDZ9 215 aa5.47□□□□□ -1.53
C1orf43-208ENST00000483282 C7orf33Q8WU49 177 aa5.47□□□□□ -1.53
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C1orf43-208ENST00000483282 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.46□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.46□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 SCXQ7RTU7 201 aa5.46□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 C15orf56Q8N910 161 aa5.46□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 LINC00208Q96KT6 92 aa5.46□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 CR1P17927 2039 aa5.46□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 M0R2N4 97 aa5.45□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 PSCAO43653 123 aa5.45□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 HTN3P15516 51 aa5.45□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 VPS13CQ709C8 3753 aa5.45□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 DNHD1Q96M86 4753 aa5.45□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 SPG11Q96JI7 2443 aa5.44□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 A0A1W2PNM2 257 aa5.44□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 SPRR1BP22528 89 aa5.44□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.44□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.43□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 A8MWP4 228 aa5.43□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 DSCR10P59022 87 aa5.43□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 MOBPQ13875 183 aa5.43□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.43□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 MTORP42345 2549 aa5.42□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 WNK1Q9H4A3 2382 aa5.42□□□□□ -1.54
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C1orf43-208ENST00000483282 Q75L30 129 aa5.42□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.41□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.4□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 C16orf90A8MZG2 172 aa5.4□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.4□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
C1orf43-208ENST00000483282 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 H0Y9P7 68 aa5.39□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 K7EQZ3 153 aa5.39□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.39□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.39□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.39□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 MDFIQ99750 246 aa5.39□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.38□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 ACANP16112 2415 aa5.38□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.38□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.38□□□□□ -1.55
C1orf43-208ENST00000483282 Q8N9L7 120 aa5.38□□□□□ -1.55
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