RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477916.5

MDS2-202, Transcript of myelodysplastic syndrome 2 translocation associated, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MDS2, Length 1,781 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDS2-202ENST00000477916 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 KMT2AQ03164 3969 aa7.07□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 VPREB1P12018 145 aa7.07□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 ESRGQ1W209 222 aa7.07□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 Q6ZQT0 140 aa7.07□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 UBL5Q9BZL1 73 aa7.07□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.07□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.06□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.06□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 M0R378 163 aa7.06□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 COX7BP24311 80 aa7.06□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 C15orf56Q8N910 161 aa7.06□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.06□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 APLNQ9ULZ1 77 aa7.06□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.05□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.05□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 Q6ZQY7 126 aa7.05□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.05□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 Q6ZRU5 148 aa7.05□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 CRYGAP11844 174 aa7.04□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 DSCR8Q96T75 97 aa7.04□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.04□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.03□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 USP17L23D6RBM5 183 aa7.03□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 SERP2Q8N6R1 65 aa7.03□□□□□ -1.28
MDS2-202ENST00000477916 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.02□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.02□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 A0A087WVE0 104 aa7.01□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.01□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 SYCNQ0VAF6 134 aa7□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 TLX1NBP0CAT3 122 aa7□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 Q6ZRP5 223 aa7□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 LINC00528Q8N1L1 170 aa7□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 BCE1O60756 84 aa6.99□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.99□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.98□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 CXCL6P80162 114 aa6.97□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.97□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 Q6ZVQ6 151 aa6.97□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 UPK3BQ9BT76 320 aa6.97□□□□□ -1.29
MDS2-202ENST00000477916 M0R2N4 97 aa6.96□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.96□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.96□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.96□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.95□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.95□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.94□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 RMI2Q96E14 147 aa6.94□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.93□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 TMEM258P61165 79 aa6.92□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 HAMPP81172 84 aa6.92□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 C7orf33Q8WU49 177 aa6.92□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.92□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 PRYO14603 147 aa6.91□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.91□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 DNAH2Q9P225 4427 aa6.9□□□□□ -1.3
MDS2-202ENST00000477916 A0A1B0GW54 56 aa6.9□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.89□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.89□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.89□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 RTL8CO15255 209 aa6.89□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 SPRR1AP35321 89 aa6.89□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 Q6ZR54 194 aa6.89□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.88□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.88□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.88□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 Q6ZRX8 168 aa6.88□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.88□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 Q8N377 158 aa6.87□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.87□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 HERC2O95714 4834 aa6.87□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 A0A1B0GVY2 172 aa6.87□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 J3KT08 172 aa6.87□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 SVIPQ8NHG7 77 aa6.87□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.85□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 PKHD1P08F94 4074 aa6.85□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.85□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 NREPQ16612 68 aa6.84□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 Q9BRP9 147 aa6.84□□□□□ -1.31
MDS2-202ENST00000477916 FAM168BA1KXE4 195 aa6.83□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.83□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 TNP2Q05952 138 aa6.83□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.83□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 DPH3Q96FX2 82 aa6.83□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 KLKP1Q107X0 134 aa6.82□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 C20orf197Q8N268 126 aa6.82□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.82□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.82□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 PKD1P98161 4303 aa6.82□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
MDS2-202ENST00000477916 SCXQ7RTU7 201 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms