RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477890.6

CPSF7-211, Transcript of cleavage and polyadenylation specific factor 7, humanhuman

TSL 5

Gene CPSF7, Length 1,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF7-211ENST00000477890 HERV-K104P63124 156 aa6.59□□□□□ -1.35
CPSF7-211ENST00000477890 MOBPQ13875 183 aa6.59□□□□□ -1.35
CPSF7-211ENST00000477890 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.59□□□□□ -1.35
CPSF7-211ENST00000477890 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.59□□□□□ -1.35
CPSF7-211ENST00000477890 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.59□□□□□ -1.35
CPSF7-211ENST00000477890 B5MCH6 92 aa6.57□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 ERC2-IT1O76042 136 aa6.57□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 Q8N377 158 aa6.57□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.57□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.57□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.57□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.56□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.56□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 VAMP8Q9BV40 100 aa6.55□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 SLC25A20O43772 301 aa6.54□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.54□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 Q9BRP9 147 aa6.54□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 H0Y8G0 127 aa6.53□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 Q6ZRX8 168 aa6.53□□□□□ -1.36
CPSF7-211ENST00000477890 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.52□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.52□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.52□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.51□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 HSBP1O75506 76 aa6.51□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 XP32Q5T750 250 aa6.51□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.51□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 LEPROTO15243 131 aa6.5□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.5□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.5□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 PCP4P48539 62 aa6.49□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.49□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.48□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 C20orf202A1L168 122 aa6.48□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 J3QQQ9 107 aa6.48□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 SERF1AO75920 110 aa6.48□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 IGLV6-57P01721 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 BATFQ16520 125 aa6.48□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.48□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 NDUFC2O95298 119 aa6.47□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 PLNP26678 52 aa6.47□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.47□□□□□ -1.37
CPSF7-211ENST00000477890 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 LEPROTL1O95214 131 aa6.46□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 NMUP48645 174 aa6.46□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 KRTDAPP60985 99 aa6.46□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 HERVK_113P61574 105 aa6.46□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 NPC2P61916 151 aa6.46□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 SPATA45Q537H7 98 aa6.46□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 LCE2CQ5TA81 110 aa6.45□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 DPM2O94777 84 aa6.44□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 LINC00310P59036 64 aa6.44□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.44□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.44□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.44□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.43□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.43□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 IGKCP01834 107 aa6.42□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 UBE2V1Q13404 147 aa6.42□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 PCOTHQ58A44 107 aa6.42□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.42□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 LIMD2Q9BT23 127 aa6.42□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.42□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 A0A0J9YXY3 114 aa6.41□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 C9orf92A6NGG3 77 aa6.41□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 C3orf79P0CE67 100 aa6.41□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.41□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.4□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 MT1HP80294 61 aa6.4□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.4□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 PET117Q6UWS5 81 aa6.4□□□□□ -1.38
CPSF7-211ENST00000477890 SPRR1BP22528 89 aa6.39□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.39□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.38□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.38□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 E9PLD3 99 aa6.37□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 CFC1BP0CG36 223 aa6.37□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 SPANXCQ9NY87 97 aa6.37□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.36□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 VAMP3Q15836 100 aa6.36□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.36□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 Q1RN00 199 aa6.35□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 LITAFQ99732 161 aa6.35□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.35□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 COX7BP24311 80 aa6.34□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 TAL2Q16559 108 aa6.34□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.34□□□□□ -1.39
CPSF7-211ENST00000477890 H7C2G1 150 aa6.33□□□□□ -1.4
CPSF7-211ENST00000477890 K7ERU9 68 aa6.33□□□□□ -1.4
CPSF7-211ENST00000477890 CD164Q04900 197 aa6.33□□□□□ -1.4
CPSF7-211ENST00000477890 C6orf99Q4VX62 202 aa6.33□□□□□ -1.4
CPSF7-211ENST00000477890 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.33□□□□□ -1.4
CPSF7-211ENST00000477890 TIMM17BO60830 172 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms