RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		8.68	□□□□□ -1.02
SSR4-208	ENST00000471880		B5MCH6	92 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		8.67	□□□□□ -1.02
SSR4-208	ENST00000471880	TIMM17B	O60830	172 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SSR4-208	ENST00000471880	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SSR4-208	ENST00000471880	LITAF	Q99732	161 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SSR4-208	ENST00000471880	SPANXC	Q9NY87	97 aa		8.66	□□□□□ -1.02
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	8.65	□□□□□ -1.02
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV6-57	P01721	117 aa		8.65	□□□□□ -1.02
SSR4-208	ENST00000471880	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	8.65	□□□□□ -1.02
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	8.64	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	AKR1D1	P51857	326 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		8.64	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	8.63	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZRX8	168 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	ERC2-IT1	O76042	136 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	PCP2	Q8IVA1	136 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880		Q9BRP9	147 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880		Q8NBF4	154 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	COPS9	Q8WXC6	57 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		8.59	□□□□□ -1.03
SSR4-208	ENST00000471880	MOBP	Q13875	183 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	RNF213	Q63HN8	5207 aa		8.58	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880		A6NDN8	102 aa		8.57	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	SCGB1D1	O95968	90 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		8.56	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	IFITM1	P13164	125 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf99	Q4VX62	202 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00483	Q53H64	154 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		8.55	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	COX7B	P24311	80 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZVH6	145 aa		8.54	□□□□□ -1.04
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		8.52	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		8.51	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		8.5	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	8.49	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	TAL2	Q16559	108 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	SPINK1	P00995	79 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	CDIP1	Q9H305	208 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	CTAG1A	P78358	180 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf52	A6NGY3	159 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GWB2	263 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	HIST1H4G	Q99525	98 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880		Q1RN00	199 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf57	Q99622	126 aa		8.44	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880		A4D1N5	150 aa		8.43	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	VAMP3	Q15836	100 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	TPRXL	Q17RH7	258 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A20	O43772	301 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	COX8A	P10176	69 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	8.4	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	C14orf144	Q96I85	54 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	8.4	□□□□□ -1.06
SSR4-208	ENST00000471880	SPRR1B	P22528	89 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA45	Q537H7	98 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SSR4-208	ENST00000471880	VAMP8	Q9BV40	100 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N377	158 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SSR4-208	ENST00000471880		H7C2G1	150 aa		8.37	□□□□□ -1.07
SSR4-208	ENST00000471880	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	8.36	□□□□□ -1.07
SSR4-208	ENST00000471880	LIMD2	Q9BT23	127 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SSR4-208	ENST00000471880	PRO1933	Q9H354	126 aa		8.35	□□□□□ -1.07
SSR4-208	ENST00000471880	RAB37	Q96AX2	223 aa		8.34	□□□□□ -1.07
SSR4-208	ENST00000471880	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	8.34	□□□□□ -1.07
SSR4-208	ENST00000471880	DLEU1	O43261	78 aa		8.33	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880		F8WEM9	126 aa		8.32	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880	hADV29S1	A0JD25	119 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00575	Q6W349	94 aa		8.31	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0G2JQZ4	141 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	8.3	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZQY7	126 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM29	Q86T20	159 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880	MUC2	Q02817	5179 aa		8.3	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0U1RQV1	116 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		8.29	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880	HIGD1B	Q9P298	99 aa		8.28	□□□□□ -1.08
SSR4-208	ENST00000471880	CFC1B	P0CG36	223 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SSR4-208	ENST00000471880	CFC1	P0CG37	223 aa		8.27	□□□□□ -1.09
SSR4-208	ENST00000471880	CD164	Q04900	197 aa		8.26	□□□□□ -1.09
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		8.26	□□□□□ -1.09

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