RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 TMEM223A0PJW6 202 aa7.37□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 MT-ND4LP03901 98 aa7.37□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 FA2HQ7L5A8 372 aa7.37□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.37□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 SMIM29Q86T20 159 aa7.36□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 BAGE3Q86Y29 109 aa7.36□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 A6NJY4 79 aa7.35□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.34□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 C20orf202A1L168 122 aa7.34□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.34□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.34□□□□□ -1.23
RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP10-10P60014 251 aa7.33□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 HERV-K104P63124 156 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 LINC00846Q9NV44 126 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 A0A0G2JQZ4 141 aa7.31□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 PMCHL1Q16048 86 aa7.31□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 PRO1933Q9H354 126 aa7.31□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.3□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 LINC00587B1AMM8 73 aa7.29□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 Q1RN00 199 aa7.29□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.29□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 HBDP02042 147 aa7.28□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 Q75L30 129 aa7.28□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.28□□□□□ -1.24
RALGPS1-211ENST00000471643 NDUFC2O95298 119 aa7.27□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.26□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.25□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 LINC00614P0C842 121 aa7.25□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 AKR1D1P51857 326 aa7.25□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.25□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 LCE1DQ5T752 114 aa7.25□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.25□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.24□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.23□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.23□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.22□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.22□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.22□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.22□□□□□ -1.25
RALGPS1-211ENST00000471643 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.21□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.21□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 TAL2Q16559 108 aa7.2□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.2□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.19□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.19□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.19□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 PCP2Q8IVA1 136 aa7.18□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.17□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 TCL1BO95988 128 aa7.17□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 NPC2P61916 151 aa7.17□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.16□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 COMMD7Q86VX2 200 aa7.16□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.16□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 SEC11CQ9BY50 192 aa7.15□□□□□ -1.26
RALGPS1-211ENST00000471643 LEPROTO15243 131 aa7.14□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 IFITM2Q01629 132 aa7.14□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 COX19Q49B96 90 aa7.14□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.14□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.13□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.13□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 COX7BP24311 80 aa7.12□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 RHEBQ15382 184 aa7.12□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 J3QQQ9 107 aa7.11□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 S100PP25815 95 aa7.11□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 C6orf99Q4VX62 202 aa7.1□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.1□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 Q96NJ1 140 aa7.1□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 A8MUU9 505 aa7.09□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.09□□□□□ -1.27
RALGPS1-211ENST00000471643 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.08□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.08□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 FAM236CP0DP71 79 aa7.08□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 NMUP48645 174 aa7.07□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 A0A0J9YXY3 114 aa7.06□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 IGFL1Q6UW32 110 aa7.06□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 SPANXCQ9NY87 97 aa7.06□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.06□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.05□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.04□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.04□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 H0Y8G0 127 aa7.03□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 HRES1P13985 223 aa7.03□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 LITAFQ99732 161 aa7.03□□□□□ -1.28
RALGPS1-211ENST00000471643 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.02□□□□□ -1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 MDN1Q9NU22 5596 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 TMEM218A2RU14 115 aa7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 PLNP26678 52 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.98□□□□□ -1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 A0A1B0GWB2 263 aa6.97□□□□□ -1.29
RALGPS1-211ENST00000471643 HERVK_113P61574 105 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms