RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.11	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710	PRLH	P81277	87 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710	HSD52	Q0P140	79 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		5.1	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710		A6NJY4	79 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710	TSTD3	H0UI37	97 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710		H7C2G1	150 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710	CFC1	P0CG37	223 aa		5.09	□□□□□ -1.59
IL6-208	ENST00000464710		H0Y9J4	135 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	SPRR1A	P35321	89 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	HSPG2	P98160	4391 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	HERC2	O95714	4834 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710		B5MCH6	92 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	COX7B	P24311	80 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	FXYD2	P54710	66 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	CTAG1A	P78358	180 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	VAMP3	Q15836	100 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710		Q1RN00	199 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710		A0A0B4J2C4	111 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	FAT1	Q14517	4588 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710		J3QL48	77 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710		M0R143	59 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710		Q6ZRX8	168 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710		A0A1B0GWB2	263 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	SLC25A20	O43772	301 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	OXT	P01178	125 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	PSMB2	P49721	201 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	BATF	Q16520	125 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IL6-208	ENST00000464710	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710		K7ERJ3	54 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710		Q9BRP9	147 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	LINC01600	Q96MT4	127 aa		5.01	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710		H0YGX0	51 aa		5	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	SNCG	O76070	127 aa		5	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		5	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	CRYGA	P11844	174 aa		5	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		5	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	COX6C	P09669	75 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.99	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	TRIAP1	O43715	76 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	TSPAN13	O95857	204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
IL6-208	ENST00000464710		A0A087X002	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.96	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710		Q6ZQY7	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710		A0A1B0GX51	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710		H3BUT2	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	DNAL4	O96015	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	SPRR1B	P22528	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	MOBP	Q13875	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710		Q8N377	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	GHRH	P01286	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	FABP2	P12104	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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