RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 C1orf137Q5JT78 98 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM126AQ9H061 195 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 PRYO14603 147 aa6.28□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 BCE1O60756 84 aa6.28□□□□□ -1.4
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GARNL3-211ENST00000460176 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.28□□□□□ -1.4
GARNL3-211ENST00000460176 REG3GQ6UW15 175 aa6.28□□□□□ -1.4
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GARNL3-211ENST00000460176 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.27□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 HERC2O95714 4834 aa6.27□□□□□ -1.41
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GARNL3-211ENST00000460176 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 A6NDN8 102 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.25□□□□□ -1.41
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GARNL3-211ENST00000460176 CFC1P0CG37 223 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 A0A0B4J2C4 111 aa6.23□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF861PO60384 105 aa6.23□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 CTAG1AP78358 180 aa6.23□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 PRLHP81277 87 aa6.23□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.23□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.23□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.22□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 H0Y9J4 135 aa6.22□□□□□ -1.41
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GARNL3-211ENST00000460176 UBE2AP49459 152 aa6.22□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.22□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.22□□□□□ -1.41
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GARNL3-211ENST00000460176 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.22□□□□□ -1.41
GARNL3-211ENST00000460176 A0A1B0GWB2 263 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 C6orf99Q4VX62 202 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 DIRC1Q969H9 104 aa6.21□□□□□ -1.42
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GARNL3-211ENST00000460176 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 Q6ZRX8 168 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 K7ERJ3 54 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 M0R143 59 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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GARNL3-211ENST00000460176 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
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GARNL3-211ENST00000460176 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.17□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.17□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 ERC2-IT1O76042 136 aa6.15□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.15□□□□□ -1.42
GARNL3-211ENST00000460176 TSPAN13O95857 204 aa6.14□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 Q1RN00 199 aa6.14□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 VAMP3Q15836 100 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 BATFQ16520 125 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 SPRR4Q96PI1 79 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00575Q6W349 94 aa6.11□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.11□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 LINC01600Q96MT4 127 aa6.11□□□□□ -1.43
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GARNL3-211ENST00000460176 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.09□□□□□ -1.43
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GARNL3-211ENST00000460176 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.09□□□□□ -1.43
GARNL3-211ENST00000460176 A0A087X002 238 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-211ENST00000460176 hADV29S1A0JD25 119 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-211ENST00000460176 SLC25A20O43772 301 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-211ENST00000460176 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-211ENST00000460176 MT1HL1P0DM35 61 aa6.07□□□□□ -1.44
GARNL3-211ENST00000460176 SPRR1BP22528 89 aa6.07□□□□□ -1.44
GARNL3-211ENST00000460176 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
GARNL3-211ENST00000460176 KRTAP10-8P60410 259 aa6.07□□□□□ -1.44
GARNL3-211ENST00000460176 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.07□□□□□ -1.44
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